Protein–RNA interactions for Protein: Q6IEE8

SLFN12L, Schlafen family member 12-like, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12LQ6IEE8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLFN12LQ6IEE8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLFN12LQ6IEE8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
SLFN12LQ6IEE8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLFN12LQ6IEE8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLFN12LQ6IEE8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLFN12LQ6IEE8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLFN12LQ6IEE8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLFN12LQ6IEE8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLFN12LQ6IEE8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLFN12LQ6IEE8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLFN12LQ6IEE8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SLFN12LQ6IEE8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLFN12LQ6IEE8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLFN12LQ6IEE8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLFN12LQ6IEE8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SLFN12LQ6IEE8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLFN12LQ6IEE8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLFN12LQ6IEE8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLFN12LQ6IEE8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SLFN12LQ6IEE8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLFN12LQ6IEE8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLFN12LQ6IEE8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLFN12LQ6IEE8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLFN12LQ6IEE8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLFN12LQ6IEE8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLFN12LQ6IEE8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLFN12LQ6IEE8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLFN12LQ6IEE8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLFN12LQ6IEE8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLFN12LQ6IEE8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLFN12LQ6IEE8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLFN12LQ6IEE8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLFN12LQ6IEE8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLFN12LQ6IEE8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLFN12LQ6IEE8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLFN12LQ6IEE8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLFN12LQ6IEE8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLFN12LQ6IEE8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLFN12LQ6IEE8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SLFN12LQ6IEE8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLFN12LQ6IEE8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SLFN12LQ6IEE8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SLFN12LQ6IEE8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLFN12LQ6IEE8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLFN12LQ6IEE8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLFN12LQ6IEE8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLFN12LQ6IEE8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLFN12LQ6IEE8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLFN12LQ6IEE8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLFN12LQ6IEE8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLFN12LQ6IEE8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLFN12LQ6IEE8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLFN12LQ6IEE8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLFN12LQ6IEE8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLFN12LQ6IEE8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLFN12LQ6IEE8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLFN12LQ6IEE8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLFN12LQ6IEE8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLFN12LQ6IEE8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLFN12LQ6IEE8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLFN12LQ6IEE8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLFN12LQ6IEE8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLFN12LQ6IEE8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLFN12LQ6IEE8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLFN12LQ6IEE8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SLFN12LQ6IEE8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLFN12LQ6IEE8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLFN12LQ6IEE8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLFN12LQ6IEE8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLFN12LQ6IEE8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLFN12LQ6IEE8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLFN12LQ6IEE8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLFN12LQ6IEE8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLFN12LQ6IEE8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLFN12LQ6IEE8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLFN12LQ6IEE8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLFN12LQ6IEE8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLFN12LQ6IEE8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SLFN12LQ6IEE8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLFN12LQ6IEE8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SLFN12LQ6IEE8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SLFN12LQ6IEE8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SLFN12LQ6IEE8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLFN12LQ6IEE8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLFN12LQ6IEE8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLFN12LQ6IEE8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLFN12LQ6IEE8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLFN12LQ6IEE8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SLFN12LQ6IEE8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFN12LQ6IEE8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFN12LQ6IEE8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFN12LQ6IEE8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFN12LQ6IEE8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFN12LQ6IEE8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFN12LQ6IEE8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLFN12LQ6IEE8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLFN12LQ6IEE8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLFN12LQ6IEE8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLFN12LQ6IEE8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms