Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKI2

LGALS9C, Galectin-9C, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS9CQ6DKI2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LGALS9CQ6DKI2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LGALS9CQ6DKI2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LGALS9CQ6DKI2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LGALS9CQ6DKI2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGALS9CQ6DKI2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGALS9CQ6DKI2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGALS9CQ6DKI2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGALS9CQ6DKI2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGALS9CQ6DKI2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGALS9CQ6DKI2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGALS9CQ6DKI2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGALS9CQ6DKI2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGALS9CQ6DKI2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGALS9CQ6DKI2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGALS9CQ6DKI2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGALS9CQ6DKI2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms