Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LHX8Q68G74 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LHX8Q68G74 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LHX8Q68G74 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LHX8Q68G74 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LHX8Q68G74 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LHX8Q68G74 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LHX8Q68G74 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LHX8Q68G74 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LHX8Q68G74 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LHX8Q68G74 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LHX8Q68G74 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LHX8Q68G74 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LHX8Q68G74 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LHX8Q68G74 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LHX8Q68G74 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LHX8Q68G74 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LHX8Q68G74 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LHX8Q68G74 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LHX8Q68G74 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LHX8Q68G74 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LHX8Q68G74 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LHX8Q68G74 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LHX8Q68G74 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LHX8Q68G74 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LHX8Q68G74 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LHX8Q68G74 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LHX8Q68G74 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LHX8Q68G74 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LHX8Q68G74 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LHX8Q68G74 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LHX8Q68G74 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LHX8Q68G74 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LHX8Q68G74 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LHX8Q68G74 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LHX8Q68G74 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LHX8Q68G74 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LHX8Q68G74 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LHX8Q68G74 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LHX8Q68G74 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LHX8Q68G74 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LHX8Q68G74 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LHX8Q68G74 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LHX8Q68G74 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LHX8Q68G74 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LHX8Q68G74 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LHX8Q68G74 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LHX8Q68G74 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LHX8Q68G74 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LHX8Q68G74 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LHX8Q68G74 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LHX8Q68G74 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LHX8Q68G74 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LHX8Q68G74 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LHX8Q68G74 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
LHX8Q68G74 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LHX8Q68G74 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LHX8Q68G74 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LHX8Q68G74 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LHX8Q68G74 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LHX8Q68G74 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LHX8Q68G74 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LHX8Q68G74 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LHX8Q68G74 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LHX8Q68G74 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LHX8Q68G74 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LHX8Q68G74 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LHX8Q68G74 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
LHX8Q68G74 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LHX8Q68G74 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LHX8Q68G74 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LHX8Q68G74 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LHX8Q68G74 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LHX8Q68G74 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LHX8Q68G74 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LHX8Q68G74 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LHX8Q68G74 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LHX8Q68G74 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LHX8Q68G74 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LHX8Q68G74 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LHX8Q68G74 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LHX8Q68G74 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LHX8Q68G74 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LHX8Q68G74 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LHX8Q68G74 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LHX8Q68G74 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LHX8Q68G74 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LHX8Q68G74 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LHX8Q68G74 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LHX8Q68G74 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LHX8Q68G74 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LHX8Q68G74 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LHX8Q68G74 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LHX8Q68G74 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LHX8Q68G74 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LHX8Q68G74 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LHX8Q68G74 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LHX8Q68G74 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LHX8Q68G74 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LHX8Q68G74 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms