Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC40.97■■■■■ 4.15
CARMIL1Q5VZK9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC40.97■■■■■ 4.15
CARMIL1Q5VZK9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CARMIL1Q5VZK9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CARMIL1Q5VZK9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
CARMIL1Q5VZK9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
CARMIL1Q5VZK9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
CARMIL1Q5VZK9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CARMIL1Q5VZK9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CARMIL1Q5VZK9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CARMIL1Q5VZK9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
CARMIL1Q5VZK9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
CARMIL1Q5VZK9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CARMIL1Q5VZK9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
CARMIL1Q5VZK9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CARMIL1Q5VZK9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CARMIL1Q5VZK9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
CARMIL1Q5VZK9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
CARMIL1Q5VZK9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
CARMIL1Q5VZK9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC40.88■■■■■ 4.14
CARMIL1Q5VZK9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC40.88■■■■■ 4.14
CARMIL1Q5VZK9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
CARMIL1Q5VZK9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
CARMIL1Q5VZK9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
CARMIL1Q5VZK9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
CARMIL1Q5VZK9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
CARMIL1Q5VZK9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CARMIL1Q5VZK9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CARMIL1Q5VZK9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CARMIL1Q5VZK9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
CARMIL1Q5VZK9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CARMIL1Q5VZK9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
CARMIL1Q5VZK9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
CARMIL1Q5VZK9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
CARMIL1Q5VZK9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
CARMIL1Q5VZK9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.13
CARMIL1Q5VZK9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
CARMIL1Q5VZK9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
CARMIL1Q5VZK9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
CARMIL1Q5VZK9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC40.82■■■■■ 4.12
CARMIL1Q5VZK9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC40.82■■■■■ 4.12
CARMIL1Q5VZK9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
CARMIL1Q5VZK9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
CARMIL1Q5VZK9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
CARMIL1Q5VZK9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
CARMIL1Q5VZK9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CARMIL1Q5VZK9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
CARMIL1Q5VZK9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
CARMIL1Q5VZK9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CARMIL1Q5VZK9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
CARMIL1Q5VZK9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
CARMIL1Q5VZK9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
CARMIL1Q5VZK9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
CARMIL1Q5VZK9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
CARMIL1Q5VZK9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CARMIL1Q5VZK9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
CARMIL1Q5VZK9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
CARMIL1Q5VZK9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
CARMIL1Q5VZK9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
CARMIL1Q5VZK9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
CARMIL1Q5VZK9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
CARMIL1Q5VZK9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
CARMIL1Q5VZK9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
CARMIL1Q5VZK9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC40.75■■■■■ 4.11
CARMIL1Q5VZK9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
CARMIL1Q5VZK9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
CARMIL1Q5VZK9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
CARMIL1Q5VZK9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
CARMIL1Q5VZK9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
CARMIL1Q5VZK9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
CARMIL1Q5VZK9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
CARMIL1Q5VZK9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
CARMIL1Q5VZK9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC40.73■■■■■ 4.11
CARMIL1Q5VZK9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
CARMIL1Q5VZK9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC40.72■■■■■ 4.11
CARMIL1Q5VZK9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC40.72■■■■■ 4.11
CARMIL1Q5VZK9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
CARMIL1Q5VZK9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
CARMIL1Q5VZK9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.71■■■■■ 4.11
CARMIL1Q5VZK9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
CARMIL1Q5VZK9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
CARMIL1Q5VZK9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
CARMIL1Q5VZK9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
CARMIL1Q5VZK9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
CARMIL1Q5VZK9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
CARMIL1Q5VZK9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC40.68■■■■■ 4.1
CARMIL1Q5VZK9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC40.68■■■■■ 4.1
CARMIL1Q5VZK9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
CARMIL1Q5VZK9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
CARMIL1Q5VZK9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
CARMIL1Q5VZK9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
CARMIL1Q5VZK9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
CARMIL1Q5VZK9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
CARMIL1Q5VZK9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC40.65■■■■■ 4.1
CARMIL1Q5VZK9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
CARMIL1Q5VZK9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
CARMIL1Q5VZK9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
CARMIL1Q5VZK9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
CARMIL1Q5VZK9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
CARMIL1Q5VZK9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 752.3 ms