Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLX4IPQ5VYV7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLX4IPQ5VYV7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLX4IPQ5VYV7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLX4IPQ5VYV7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLX4IPQ5VYV7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLX4IPQ5VYV7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLX4IPQ5VYV7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLX4IPQ5VYV7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLX4IPQ5VYV7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLX4IPQ5VYV7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLX4IPQ5VYV7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLX4IPQ5VYV7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLX4IPQ5VYV7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLX4IPQ5VYV7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLX4IPQ5VYV7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLX4IPQ5VYV7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLX4IPQ5VYV7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLX4IPQ5VYV7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLX4IPQ5VYV7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLX4IPQ5VYV7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLX4IPQ5VYV7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLX4IPQ5VYV7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLX4IPQ5VYV7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLX4IPQ5VYV7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLX4IPQ5VYV7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLX4IPQ5VYV7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLX4IPQ5VYV7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLX4IPQ5VYV7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLX4IPQ5VYV7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLX4IPQ5VYV7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLX4IPQ5VYV7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLX4IPQ5VYV7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLX4IPQ5VYV7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLX4IPQ5VYV7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLX4IPQ5VYV7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLX4IPQ5VYV7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLX4IPQ5VYV7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLX4IPQ5VYV7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLX4IPQ5VYV7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLX4IPQ5VYV7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLX4IPQ5VYV7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLX4IPQ5VYV7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLX4IPQ5VYV7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLX4IPQ5VYV7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLX4IPQ5VYV7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLX4IPQ5VYV7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLX4IPQ5VYV7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLX4IPQ5VYV7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLX4IPQ5VYV7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLX4IPQ5VYV7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLX4IPQ5VYV7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLX4IPQ5VYV7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX4IPQ5VYV7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX4IPQ5VYV7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX4IPQ5VYV7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX4IPQ5VYV7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX4IPQ5VYV7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLX4IPQ5VYV7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLX4IPQ5VYV7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLX4IPQ5VYV7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLX4IPQ5VYV7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLX4IPQ5VYV7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLX4IPQ5VYV7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX4IPQ5VYV7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX4IPQ5VYV7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX4IPQ5VYV7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLX4IPQ5VYV7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLX4IPQ5VYV7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLX4IPQ5VYV7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms