Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GARNL3Q5VVW2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GARNL3Q5VVW2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GARNL3Q5VVW2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GARNL3Q5VVW2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GARNL3Q5VVW2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GARNL3Q5VVW2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GARNL3Q5VVW2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GARNL3Q5VVW2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GARNL3Q5VVW2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GARNL3Q5VVW2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GARNL3Q5VVW2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GARNL3Q5VVW2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GARNL3Q5VVW2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GARNL3Q5VVW2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GARNL3Q5VVW2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GARNL3Q5VVW2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GARNL3Q5VVW2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GARNL3Q5VVW2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GARNL3Q5VVW2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GARNL3Q5VVW2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GARNL3Q5VVW2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GARNL3Q5VVW2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GARNL3Q5VVW2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GARNL3Q5VVW2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GARNL3Q5VVW2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GARNL3Q5VVW2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GARNL3Q5VVW2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GARNL3Q5VVW2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GARNL3Q5VVW2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GARNL3Q5VVW2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GARNL3Q5VVW2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GARNL3Q5VVW2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GARNL3Q5VVW2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GARNL3Q5VVW2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GARNL3Q5VVW2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GARNL3Q5VVW2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GARNL3Q5VVW2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GARNL3Q5VVW2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GARNL3Q5VVW2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GARNL3Q5VVW2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GARNL3Q5VVW2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GARNL3Q5VVW2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GARNL3Q5VVW2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GARNL3Q5VVW2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GARNL3Q5VVW2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GARNL3Q5VVW2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GARNL3Q5VVW2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GARNL3Q5VVW2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GARNL3Q5VVW2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GARNL3Q5VVW2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GARNL3Q5VVW2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GARNL3Q5VVW2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GARNL3Q5VVW2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GARNL3Q5VVW2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GARNL3Q5VVW2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GARNL3Q5VVW2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GARNL3Q5VVW2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GARNL3Q5VVW2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GARNL3Q5VVW2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GARNL3Q5VVW2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GARNL3Q5VVW2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GARNL3Q5VVW2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GARNL3Q5VVW2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GARNL3Q5VVW2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GARNL3Q5VVW2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GARNL3Q5VVW2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GARNL3Q5VVW2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GARNL3Q5VVW2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GARNL3Q5VVW2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GARNL3Q5VVW2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GARNL3Q5VVW2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GARNL3Q5VVW2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GARNL3Q5VVW2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GARNL3Q5VVW2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GARNL3Q5VVW2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GARNL3Q5VVW2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GARNL3Q5VVW2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GARNL3Q5VVW2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GARNL3Q5VVW2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GARNL3Q5VVW2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GARNL3Q5VVW2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GARNL3Q5VVW2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GARNL3Q5VVW2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GARNL3Q5VVW2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GARNL3Q5VVW2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GARNL3Q5VVW2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GARNL3Q5VVW2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GARNL3Q5VVW2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GARNL3Q5VVW2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GARNL3Q5VVW2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GARNL3Q5VVW2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GARNL3Q5VVW2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GARNL3Q5VVW2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GARNL3Q5VVW2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GARNL3Q5VVW2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GARNL3Q5VVW2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GARNL3Q5VVW2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GARNL3Q5VVW2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GARNL3Q5VVW2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms