Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HES3Q5TGS1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HES3Q5TGS1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HES3Q5TGS1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HES3Q5TGS1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HES3Q5TGS1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HES3Q5TGS1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HES3Q5TGS1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HES3Q5TGS1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HES3Q5TGS1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HES3Q5TGS1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HES3Q5TGS1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HES3Q5TGS1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HES3Q5TGS1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HES3Q5TGS1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HES3Q5TGS1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HES3Q5TGS1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HES3Q5TGS1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HES3Q5TGS1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HES3Q5TGS1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HES3Q5TGS1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HES3Q5TGS1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HES3Q5TGS1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HES3Q5TGS1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HES3Q5TGS1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HES3Q5TGS1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HES3Q5TGS1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HES3Q5TGS1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HES3Q5TGS1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HES3Q5TGS1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HES3Q5TGS1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HES3Q5TGS1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HES3Q5TGS1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HES3Q5TGS1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HES3Q5TGS1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HES3Q5TGS1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HES3Q5TGS1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HES3Q5TGS1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HES3Q5TGS1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HES3Q5TGS1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HES3Q5TGS1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HES3Q5TGS1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HES3Q5TGS1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HES3Q5TGS1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HES3Q5TGS1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HES3Q5TGS1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HES3Q5TGS1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HES3Q5TGS1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HES3Q5TGS1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HES3Q5TGS1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HES3Q5TGS1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HES3Q5TGS1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HES3Q5TGS1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HES3Q5TGS1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HES3Q5TGS1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HES3Q5TGS1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HES3Q5TGS1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HES3Q5TGS1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HES3Q5TGS1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HES3Q5TGS1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HES3Q5TGS1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HES3Q5TGS1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HES3Q5TGS1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HES3Q5TGS1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HES3Q5TGS1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HES3Q5TGS1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HES3Q5TGS1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HES3Q5TGS1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HES3Q5TGS1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HES3Q5TGS1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HES3Q5TGS1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HES3Q5TGS1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HES3Q5TGS1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HES3Q5TGS1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HES3Q5TGS1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HES3Q5TGS1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HES3Q5TGS1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HES3Q5TGS1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HES3Q5TGS1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HES3Q5TGS1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HES3Q5TGS1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HES3Q5TGS1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HES3Q5TGS1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HES3Q5TGS1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HES3Q5TGS1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HES3Q5TGS1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HES3Q5TGS1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HES3Q5TGS1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HES3Q5TGS1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HES3Q5TGS1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HES3Q5TGS1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HES3Q5TGS1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HES3Q5TGS1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HES3Q5TGS1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HES3Q5TGS1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HES3Q5TGS1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HES3Q5TGS1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HES3Q5TGS1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HES3Q5TGS1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HES3Q5TGS1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms