Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0L3

SPATA46, Spermatogenesis-associated protein 46, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA46Q5T0L3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPATA46Q5T0L3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPATA46Q5T0L3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SPATA46Q5T0L3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SPATA46Q5T0L3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPATA46Q5T0L3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPATA46Q5T0L3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPATA46Q5T0L3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPATA46Q5T0L3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPATA46Q5T0L3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPATA46Q5T0L3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPATA46Q5T0L3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPATA46Q5T0L3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SPATA46Q5T0L3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPATA46Q5T0L3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPATA46Q5T0L3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SPATA46Q5T0L3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SPATA46Q5T0L3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPATA46Q5T0L3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPATA46Q5T0L3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPATA46Q5T0L3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPATA46Q5T0L3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPATA46Q5T0L3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SPATA46Q5T0L3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA46Q5T0L3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA46Q5T0L3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SPATA46Q5T0L3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA46Q5T0L3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA46Q5T0L3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA46Q5T0L3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA46Q5T0L3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA46Q5T0L3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA46Q5T0L3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA46Q5T0L3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA46Q5T0L3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA46Q5T0L3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA46Q5T0L3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA46Q5T0L3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA46Q5T0L3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA46Q5T0L3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA46Q5T0L3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA46Q5T0L3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPATA46Q5T0L3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPATA46Q5T0L3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPATA46Q5T0L3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPATA46Q5T0L3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPATA46Q5T0L3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPATA46Q5T0L3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPATA46Q5T0L3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPATA46Q5T0L3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPATA46Q5T0L3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPATA46Q5T0L3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPATA46Q5T0L3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPATA46Q5T0L3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPATA46Q5T0L3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPATA46Q5T0L3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPATA46Q5T0L3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPATA46Q5T0L3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPATA46Q5T0L3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms