Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRMS1LQ5PSV4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRMS1LQ5PSV4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRMS1LQ5PSV4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
BRMS1LQ5PSV4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRMS1LQ5PSV4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRMS1LQ5PSV4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRMS1LQ5PSV4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRMS1LQ5PSV4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRMS1LQ5PSV4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRMS1LQ5PSV4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRMS1LQ5PSV4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRMS1LQ5PSV4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRMS1LQ5PSV4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRMS1LQ5PSV4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRMS1LQ5PSV4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRMS1LQ5PSV4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRMS1LQ5PSV4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRMS1LQ5PSV4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRMS1LQ5PSV4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRMS1LQ5PSV4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRMS1LQ5PSV4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BRMS1LQ5PSV4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRMS1LQ5PSV4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRMS1LQ5PSV4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRMS1LQ5PSV4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRMS1LQ5PSV4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRMS1LQ5PSV4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRMS1LQ5PSV4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRMS1LQ5PSV4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BRMS1LQ5PSV4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BRMS1LQ5PSV4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRMS1LQ5PSV4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRMS1LQ5PSV4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BRMS1LQ5PSV4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRMS1LQ5PSV4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRMS1LQ5PSV4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRMS1LQ5PSV4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
BRMS1LQ5PSV4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRMS1LQ5PSV4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRMS1LQ5PSV4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRMS1LQ5PSV4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRMS1LQ5PSV4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRMS1LQ5PSV4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRMS1LQ5PSV4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRMS1LQ5PSV4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRMS1LQ5PSV4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRMS1LQ5PSV4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRMS1LQ5PSV4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRMS1LQ5PSV4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
BRMS1LQ5PSV4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRMS1LQ5PSV4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRMS1LQ5PSV4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRMS1LQ5PSV4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRMS1LQ5PSV4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRMS1LQ5PSV4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BRMS1LQ5PSV4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRMS1LQ5PSV4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRMS1LQ5PSV4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRMS1LQ5PSV4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BRMS1LQ5PSV4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRMS1LQ5PSV4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRMS1LQ5PSV4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRMS1LQ5PSV4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRMS1LQ5PSV4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BRMS1LQ5PSV4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRMS1LQ5PSV4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRMS1LQ5PSV4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRMS1LQ5PSV4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRMS1LQ5PSV4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BRMS1LQ5PSV4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRMS1LQ5PSV4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRMS1LQ5PSV4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRMS1LQ5PSV4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRMS1LQ5PSV4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRMS1LQ5PSV4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRMS1LQ5PSV4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRMS1LQ5PSV4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRMS1LQ5PSV4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRMS1LQ5PSV4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRMS1LQ5PSV4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BRMS1LQ5PSV4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BRMS1LQ5PSV4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRMS1LQ5PSV4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRMS1LQ5PSV4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRMS1LQ5PSV4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRMS1LQ5PSV4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRMS1LQ5PSV4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRMS1LQ5PSV4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRMS1LQ5PSV4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BRMS1LQ5PSV4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRMS1LQ5PSV4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRMS1LQ5PSV4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRMS1LQ5PSV4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRMS1LQ5PSV4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRMS1LQ5PSV4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRMS1LQ5PSV4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRMS1LQ5PSV4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRMS1LQ5PSV4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms