Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC158Q5M9N0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC158Q5M9N0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC158Q5M9N0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC158Q5M9N0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC158Q5M9N0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC158Q5M9N0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC158Q5M9N0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC158Q5M9N0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC158Q5M9N0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC158Q5M9N0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC158Q5M9N0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC158Q5M9N0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC158Q5M9N0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC158Q5M9N0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CCDC158Q5M9N0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
CCDC158Q5M9N0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms