Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL12Q53G59 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL12Q53G59 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL12Q53G59 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL12Q53G59 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL12Q53G59 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL12Q53G59 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL12Q53G59 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL12Q53G59 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL12Q53G59 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL12Q53G59 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL12Q53G59 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL12Q53G59 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL12Q53G59 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL12Q53G59 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KLHL12Q53G59 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL12Q53G59 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL12Q53G59 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHL12Q53G59 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHL12Q53G59 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms