Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TPRNQ4KMQ1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TPRNQ4KMQ1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TPRNQ4KMQ1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TPRNQ4KMQ1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TPRNQ4KMQ1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TPRNQ4KMQ1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TPRNQ4KMQ1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TPRNQ4KMQ1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TPRNQ4KMQ1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TPRNQ4KMQ1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TPRNQ4KMQ1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TPRNQ4KMQ1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TPRNQ4KMQ1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TPRNQ4KMQ1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TPRNQ4KMQ1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TPRNQ4KMQ1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TPRNQ4KMQ1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TPRNQ4KMQ1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TPRNQ4KMQ1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TPRNQ4KMQ1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TPRNQ4KMQ1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TPRNQ4KMQ1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TPRNQ4KMQ1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TPRNQ4KMQ1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TPRNQ4KMQ1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TPRNQ4KMQ1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TPRNQ4KMQ1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TPRNQ4KMQ1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TPRNQ4KMQ1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TPRNQ4KMQ1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TPRNQ4KMQ1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TPRNQ4KMQ1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TPRNQ4KMQ1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TPRNQ4KMQ1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TPRNQ4KMQ1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TPRNQ4KMQ1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TPRNQ4KMQ1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TPRNQ4KMQ1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TPRNQ4KMQ1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TPRNQ4KMQ1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TPRNQ4KMQ1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TPRNQ4KMQ1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TPRNQ4KMQ1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TPRNQ4KMQ1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TPRNQ4KMQ1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TPRNQ4KMQ1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TPRNQ4KMQ1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TPRNQ4KMQ1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TPRNQ4KMQ1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TPRNQ4KMQ1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TPRNQ4KMQ1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TPRNQ4KMQ1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TPRNQ4KMQ1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TPRNQ4KMQ1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TPRNQ4KMQ1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TPRNQ4KMQ1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TPRNQ4KMQ1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TPRNQ4KMQ1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TPRNQ4KMQ1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TPRNQ4KMQ1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TPRNQ4KMQ1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TPRNQ4KMQ1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TPRNQ4KMQ1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TPRNQ4KMQ1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TPRNQ4KMQ1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TPRNQ4KMQ1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TPRNQ4KMQ1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TPRNQ4KMQ1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TPRNQ4KMQ1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TPRNQ4KMQ1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TPRNQ4KMQ1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TPRNQ4KMQ1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TPRNQ4KMQ1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TPRNQ4KMQ1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TPRNQ4KMQ1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TPRNQ4KMQ1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TPRNQ4KMQ1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TPRNQ4KMQ1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TPRNQ4KMQ1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TPRNQ4KMQ1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TPRNQ4KMQ1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TPRNQ4KMQ1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TPRNQ4KMQ1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TPRNQ4KMQ1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TPRNQ4KMQ1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TPRNQ4KMQ1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TPRNQ4KMQ1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TPRNQ4KMQ1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TPRNQ4KMQ1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TPRNQ4KMQ1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TPRNQ4KMQ1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TPRNQ4KMQ1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TPRNQ4KMQ1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TPRNQ4KMQ1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TPRNQ4KMQ1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TPRNQ4KMQ1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TPRNQ4KMQ1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TPRNQ4KMQ1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TPRNQ4KMQ1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
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