Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BBS9Q3SYG4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BBS9Q3SYG4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BBS9Q3SYG4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BBS9Q3SYG4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BBS9Q3SYG4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BBS9Q3SYG4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BBS9Q3SYG4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBS9Q3SYG4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBS9Q3SYG4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBS9Q3SYG4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BBS9Q3SYG4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBS9Q3SYG4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBS9Q3SYG4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBS9Q3SYG4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBS9Q3SYG4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBS9Q3SYG4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBS9Q3SYG4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBS9Q3SYG4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBS9Q3SYG4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBS9Q3SYG4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BBS9Q3SYG4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBS9Q3SYG4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BBS9Q3SYG4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BBS9Q3SYG4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BBS9Q3SYG4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BBS9Q3SYG4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BBS9Q3SYG4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BBS9Q3SYG4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BBS9Q3SYG4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BBS9Q3SYG4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BBS9Q3SYG4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BBS9Q3SYG4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BBS9Q3SYG4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BBS9Q3SYG4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BBS9Q3SYG4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BBS9Q3SYG4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BBS9Q3SYG4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BBS9Q3SYG4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BBS9Q3SYG4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BBS9Q3SYG4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BBS9Q3SYG4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BBS9Q3SYG4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BBS9Q3SYG4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BBS9Q3SYG4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BBS9Q3SYG4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBS9Q3SYG4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBS9Q3SYG4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBS9Q3SYG4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBS9Q3SYG4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBS9Q3SYG4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBS9Q3SYG4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBS9Q3SYG4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBS9Q3SYG4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBS9Q3SYG4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBS9Q3SYG4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBS9Q3SYG4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBS9Q3SYG4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBS9Q3SYG4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBS9Q3SYG4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BBS9Q3SYG4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BBS9Q3SYG4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BBS9Q3SYG4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BBS9Q3SYG4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BBS9Q3SYG4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BBS9Q3SYG4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BBS9Q3SYG4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BBS9Q3SYG4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBS9Q3SYG4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBS9Q3SYG4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBS9Q3SYG4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBS9Q3SYG4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBS9Q3SYG4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBS9Q3SYG4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBS9Q3SYG4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBS9Q3SYG4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBS9Q3SYG4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBS9Q3SYG4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBS9Q3SYG4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BBS9Q3SYG4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BBS9Q3SYG4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BBS9Q3SYG4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BBS9Q3SYG4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BBS9Q3SYG4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBS9Q3SYG4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBS9Q3SYG4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBS9Q3SYG4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBS9Q3SYG4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBS9Q3SYG4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBS9Q3SYG4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBS9Q3SYG4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBS9Q3SYG4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBS9Q3SYG4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBS9Q3SYG4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BBS9Q3SYG4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BBS9Q3SYG4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BBS9Q3SYG4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BBS9Q3SYG4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BBS9Q3SYG4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BBS9Q3SYG4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms