Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KRTAP13-3Q3SY46 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KRTAP13-3Q3SY46 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KRTAP13-3Q3SY46 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KRTAP13-3Q3SY46 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KRTAP13-3Q3SY46 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KRTAP13-3Q3SY46 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KRTAP13-3Q3SY46 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KRTAP13-3Q3SY46 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KRTAP13-3Q3SY46 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KRTAP13-3Q3SY46 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KRTAP13-3Q3SY46 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KRTAP13-3Q3SY46 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KRTAP13-3Q3SY46 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
KRTAP13-3Q3SY46 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KRTAP13-3Q3SY46 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KRTAP13-3Q3SY46 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KRTAP13-3Q3SY46 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KRTAP13-3Q3SY46 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KRTAP13-3Q3SY46 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KRTAP13-3Q3SY46 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KRTAP13-3Q3SY46 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KRTAP13-3Q3SY46 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
KRTAP13-3Q3SY46 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KRTAP13-3Q3SY46 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KRTAP13-3Q3SY46 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KRTAP13-3Q3SY46 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
KRTAP13-3Q3SY46 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KRTAP13-3Q3SY46 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KRTAP13-3Q3SY46 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KRTAP13-3Q3SY46 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KRTAP13-3Q3SY46 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
KRTAP13-3Q3SY46 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
KRTAP13-3Q3SY46 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
KRTAP13-3Q3SY46 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
KRTAP13-3Q3SY46 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
KRTAP13-3Q3SY46 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
KRTAP13-3Q3SY46 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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KRTAP13-3Q3SY46 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KRTAP13-3Q3SY46 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
KRTAP13-3Q3SY46 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KRTAP13-3Q3SY46 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KRTAP13-3Q3SY46 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KRTAP13-3Q3SY46 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP13-3Q3SY46 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP13-3Q3SY46 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP13-3Q3SY46 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP13-3Q3SY46 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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