Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFIL3Q16649 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFIL3Q16649 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFIL3Q16649 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFIL3Q16649 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFIL3Q16649 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFIL3Q16649 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFIL3Q16649 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NFIL3Q16649 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFIL3Q16649 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFIL3Q16649 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFIL3Q16649 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFIL3Q16649 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFIL3Q16649 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFIL3Q16649 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFIL3Q16649 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFIL3Q16649 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFIL3Q16649 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFIL3Q16649 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFIL3Q16649 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFIL3Q16649 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFIL3Q16649 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFIL3Q16649 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NFIL3Q16649 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NFIL3Q16649 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NFIL3Q16649 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NFIL3Q16649 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NFIL3Q16649 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NFIL3Q16649 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFIL3Q16649 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFIL3Q16649 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFIL3Q16649 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFIL3Q16649 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFIL3Q16649 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NFIL3Q16649 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFIL3Q16649 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFIL3Q16649 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFIL3Q16649 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFIL3Q16649 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFIL3Q16649 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
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NFIL3Q16649 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFIL3Q16649 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
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NFIL3Q16649 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFIL3Q16649 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
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NFIL3Q16649 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFIL3Q16649 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
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NFIL3Q16649 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
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NFIL3Q16649 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
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NFIL3Q16649 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
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NFIL3Q16649 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NFIL3Q16649 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFIL3Q16649 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFIL3Q16649 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
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NFIL3Q16649 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NFIL3Q16649 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NFIL3Q16649 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
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NFIL3Q16649 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
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NFIL3Q16649 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
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NFIL3Q16649 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFIL3Q16649 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFIL3Q16649 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFIL3Q16649 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFIL3Q16649 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFIL3Q16649 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFIL3Q16649 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFIL3Q16649 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFIL3Q16649 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFIL3Q16649 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFIL3Q16649 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFIL3Q16649 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFIL3Q16649 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFIL3Q16649 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFIL3Q16649 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFIL3Q16649 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFIL3Q16649 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFIL3Q16649 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NFIL3Q16649 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFIL3Q16649 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFIL3Q16649 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
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