Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAPC1Q16533 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNAPC1Q16533 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAPC1Q16533 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAPC1Q16533 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAPC1Q16533 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAPC1Q16533 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAPC1Q16533 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAPC1Q16533 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAPC1Q16533 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAPC1Q16533 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAPC1Q16533 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAPC1Q16533 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAPC1Q16533 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAPC1Q16533 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAPC1Q16533 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAPC1Q16533 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAPC1Q16533 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAPC1Q16533 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAPC1Q16533 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAPC1Q16533 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAPC1Q16533 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAPC1Q16533 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAPC1Q16533 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAPC1Q16533 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAPC1Q16533 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAPC1Q16533 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAPC1Q16533 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAPC1Q16533 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAPC1Q16533 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAPC1Q16533 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAPC1Q16533 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAPC1Q16533 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAPC1Q16533 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAPC1Q16533 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAPC1Q16533 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNAPC1Q16533 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNAPC1Q16533 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAPC1Q16533 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAPC1Q16533 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAPC1Q16533 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAPC1Q16533 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAPC1Q16533 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAPC1Q16533 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAPC1Q16533 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAPC1Q16533 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAPC1Q16533 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAPC1Q16533 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAPC1Q16533 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAPC1Q16533 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAPC1Q16533 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAPC1Q16533 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAPC1Q16533 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAPC1Q16533 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAPC1Q16533 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAPC1Q16533 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAPC1Q16533 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAPC1Q16533 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAPC1Q16533 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAPC1Q16533 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAPC1Q16533 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAPC1Q16533 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAPC1Q16533 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAPC1Q16533 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAPC1Q16533 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAPC1Q16533 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAPC1Q16533 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAPC1Q16533 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAPC1Q16533 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNAPC1Q16533 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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