Protein–RNA interactions for Protein: Q15907

RAB11B, Ras-related protein Rab-11B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11BQ15907 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB11BQ15907 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB11BQ15907 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB11BQ15907 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB11BQ15907 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB11BQ15907 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB11BQ15907 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB11BQ15907 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB11BQ15907 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RAB11BQ15907 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB11BQ15907 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB11BQ15907 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB11BQ15907 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB11BQ15907 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB11BQ15907 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB11BQ15907 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAB11BQ15907 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAB11BQ15907 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB11BQ15907 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB11BQ15907 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB11BQ15907 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB11BQ15907 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB11BQ15907 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB11BQ15907 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB11BQ15907 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB11BQ15907 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB11BQ15907 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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RAB11BQ15907 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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RAB11BQ15907 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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RAB11BQ15907 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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RAB11BQ15907 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RAB11BQ15907 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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RAB11BQ15907 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB11BQ15907 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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RAB11BQ15907 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB11BQ15907 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB11BQ15907 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB11BQ15907 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB11BQ15907 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB11BQ15907 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB11BQ15907 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB11BQ15907 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB11BQ15907 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB11BQ15907 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB11BQ15907 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB11BQ15907 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB11BQ15907 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB11BQ15907 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB11BQ15907 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB11BQ15907 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB11BQ15907 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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