Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDSNQ15517 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDSNQ15517 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDSNQ15517 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDSNQ15517 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDSNQ15517 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDSNQ15517 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDSNQ15517 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDSNQ15517 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDSNQ15517 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDSNQ15517 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDSNQ15517 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDSNQ15517 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDSNQ15517 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CDSNQ15517 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDSNQ15517 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CDSNQ15517 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDSNQ15517 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDSNQ15517 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDSNQ15517 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDSNQ15517 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDSNQ15517 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDSNQ15517 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDSNQ15517 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDSNQ15517 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDSNQ15517 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDSNQ15517 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDSNQ15517 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDSNQ15517 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDSNQ15517 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDSNQ15517 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDSNQ15517 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CDSNQ15517 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDSNQ15517 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDSNQ15517 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CDSNQ15517 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CDSNQ15517 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CDSNQ15517 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDSNQ15517 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDSNQ15517 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDSNQ15517 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDSNQ15517 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDSNQ15517 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDSNQ15517 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDSNQ15517 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDSNQ15517 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDSNQ15517 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDSNQ15517 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CDSNQ15517 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDSNQ15517 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CDSNQ15517 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CDSNQ15517 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDSNQ15517 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDSNQ15517 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CDSNQ15517 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CDSNQ15517 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDSNQ15517 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms