Protein–RNA interactions for Protein: Q15293

RCN1, Reticulocalbin-1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN1Q15293 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RCN1Q15293 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCN1Q15293 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCN1Q15293 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCN1Q15293 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCN1Q15293 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCN1Q15293 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCN1Q15293 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCN1Q15293 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCN1Q15293 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCN1Q15293 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCN1Q15293 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCN1Q15293 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RCN1Q15293 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RCN1Q15293 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCN1Q15293 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCN1Q15293 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCN1Q15293 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCN1Q15293 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCN1Q15293 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCN1Q15293 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCN1Q15293 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCN1Q15293 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCN1Q15293 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCN1Q15293 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCN1Q15293 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCN1Q15293 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCN1Q15293 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCN1Q15293 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCN1Q15293 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCN1Q15293 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCN1Q15293 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCN1Q15293 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCN1Q15293 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCN1Q15293 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCN1Q15293 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCN1Q15293 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCN1Q15293 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCN1Q15293 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCN1Q15293 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCN1Q15293 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCN1Q15293 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCN1Q15293 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCN1Q15293 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCN1Q15293 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCN1Q15293 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCN1Q15293 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCN1Q15293 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCN1Q15293 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCN1Q15293 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCN1Q15293 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCN1Q15293 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCN1Q15293 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCN1Q15293 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCN1Q15293 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCN1Q15293 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCN1Q15293 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCN1Q15293 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCN1Q15293 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RCN1Q15293 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
RCN1Q15293 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCN1Q15293 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCN1Q15293 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCN1Q15293 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCN1Q15293 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCN1Q15293 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCN1Q15293 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RCN1Q15293 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCN1Q15293 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCN1Q15293 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCN1Q15293 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCN1Q15293 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCN1Q15293 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
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