Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CHD4Q14839 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CHD4Q14839 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CHD4Q14839 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CHD4Q14839 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CHD4Q14839 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CHD4Q14839 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CHD4Q14839 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
CHD4Q14839 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CHD4Q14839 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CHD4Q14839 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CHD4Q14839 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CHD4Q14839 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CHD4Q14839 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CHD4Q14839 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CHD4Q14839 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CHD4Q14839 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CHD4Q14839 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
CHD4Q14839 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CHD4Q14839 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CHD4Q14839 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CHD4Q14839 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CHD4Q14839 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
CHD4Q14839 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CHD4Q14839 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
CHD4Q14839 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CHD4Q14839 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CHD4Q14839 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CHD4Q14839 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CHD4Q14839 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CHD4Q14839 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CHD4Q14839 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CHD4Q14839 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
CHD4Q14839 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CHD4Q14839 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CHD4Q14839 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CHD4Q14839 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CHD4Q14839 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
CHD4Q14839 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CHD4Q14839 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHD4Q14839 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
CHD4Q14839 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
CHD4Q14839 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CHD4Q14839 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
CHD4Q14839 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CHD4Q14839 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CHD4Q14839 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CHD4Q14839 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CHD4Q14839 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CHD4Q14839 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CHD4Q14839 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CHD4Q14839 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CHD4Q14839 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
CHD4Q14839 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
CHD4Q14839 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CHD4Q14839 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CHD4Q14839 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CHD4Q14839 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CHD4Q14839 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CHD4Q14839 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
CHD4Q14839 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CHD4Q14839 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CHD4Q14839 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CHD4Q14839 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CHD4Q14839 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CHD4Q14839 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CHD4Q14839 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CHD4Q14839 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CHD4Q14839 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CHD4Q14839 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CHD4Q14839 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CHD4Q14839 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CHD4Q14839 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CHD4Q14839 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CHD4Q14839 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CHD4Q14839 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CHD4Q14839 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CHD4Q14839 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHD4Q14839 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CHD4Q14839 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CHD4Q14839 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CHD4Q14839 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CHD4Q14839 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CHD4Q14839 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CHD4Q14839 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CHD4Q14839 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CHD4Q14839 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CHD4Q14839 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CHD4Q14839 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
CHD4Q14839 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CHD4Q14839 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CHD4Q14839 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CHD4Q14839 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CHD4Q14839 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CHD4Q14839 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CHD4Q14839 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
CHD4Q14839 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
CHD4Q14839 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CHD4Q14839 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CHD4Q14839 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
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