Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NBR1Q14596 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NBR1Q14596 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NBR1Q14596 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
NBR1Q14596 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NBR1Q14596 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NBR1Q14596 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NBR1Q14596 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NBR1Q14596 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NBR1Q14596 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NBR1Q14596 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NBR1Q14596 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NBR1Q14596 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NBR1Q14596 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
NBR1Q14596 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NBR1Q14596 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NBR1Q14596 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NBR1Q14596 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NBR1Q14596 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NBR1Q14596 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NBR1Q14596 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NBR1Q14596 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NBR1Q14596 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NBR1Q14596 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NBR1Q14596 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NBR1Q14596 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NBR1Q14596 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
NBR1Q14596 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NBR1Q14596 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NBR1Q14596 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NBR1Q14596 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NBR1Q14596 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NBR1Q14596 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NBR1Q14596 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NBR1Q14596 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NBR1Q14596 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NBR1Q14596 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NBR1Q14596 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NBR1Q14596 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NBR1Q14596 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NBR1Q14596 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NBR1Q14596 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NBR1Q14596 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NBR1Q14596 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NBR1Q14596 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NBR1Q14596 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NBR1Q14596 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NBR1Q14596 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NBR1Q14596 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NBR1Q14596 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
NBR1Q14596 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NBR1Q14596 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NBR1Q14596 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NBR1Q14596 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NBR1Q14596 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NBR1Q14596 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NBR1Q14596 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NBR1Q14596 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NBR1Q14596 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NBR1Q14596 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NBR1Q14596 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NBR1Q14596 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NBR1Q14596 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NBR1Q14596 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NBR1Q14596 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
NBR1Q14596 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
NBR1Q14596 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NBR1Q14596 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
NBR1Q14596 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
NBR1Q14596 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NBR1Q14596 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NBR1Q14596 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NBR1Q14596 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
NBR1Q14596 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NBR1Q14596 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NBR1Q14596 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NBR1Q14596 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NBR1Q14596 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NBR1Q14596 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NBR1Q14596 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NBR1Q14596 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NBR1Q14596 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NBR1Q14596 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NBR1Q14596 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NBR1Q14596 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NBR1Q14596 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NBR1Q14596 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NBR1Q14596 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NBR1Q14596 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NBR1Q14596 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NBR1Q14596 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NBR1Q14596 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NBR1Q14596 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NBR1Q14596 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NBR1Q14596 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NBR1Q14596 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NBR1Q14596 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NBR1Q14596 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NBR1Q14596 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
NBR1Q14596 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms