Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP1A4Q13733 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP1A4Q13733 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP1A4Q13733 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP1A4Q13733 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP1A4Q13733 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP1A4Q13733 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP1A4Q13733 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP1A4Q13733 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP1A4Q13733 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP1A4Q13733 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP1A4Q13733 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP1A4Q13733 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP1A4Q13733 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP1A4Q13733 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP1A4Q13733 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP1A4Q13733 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP1A4Q13733 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP1A4Q13733 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP1A4Q13733 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP1A4Q13733 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP1A4Q13733 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP1A4Q13733 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP1A4Q13733 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP1A4Q13733 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP1A4Q13733 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP1A4Q13733 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP1A4Q13733 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP1A4Q13733 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP1A4Q13733 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP1A4Q13733 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP1A4Q13733 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP1A4Q13733 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP1A4Q13733 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP1A4Q13733 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP1A4Q13733 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP1A4Q13733 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP1A4Q13733 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP1A4Q13733 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A4Q13733 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
ATP1A4Q13733 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A4Q13733 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A4Q13733 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A4Q13733 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A4Q13733 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A4Q13733 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A4Q13733 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A4Q13733 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A4Q13733 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A4Q13733 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A4Q13733 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A4Q13733 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A4Q13733 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A4Q13733 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A4Q13733 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
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