Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CACNA1SQ13698 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CACNA1SQ13698 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CACNA1SQ13698 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CACNA1SQ13698 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CACNA1SQ13698 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
CACNA1SQ13698 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CACNA1SQ13698 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CACNA1SQ13698 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
CACNA1SQ13698 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CACNA1SQ13698 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CACNA1SQ13698 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CACNA1SQ13698 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CACNA1SQ13698 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CACNA1SQ13698 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CACNA1SQ13698 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CACNA1SQ13698 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CACNA1SQ13698 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CACNA1SQ13698 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CACNA1SQ13698 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CACNA1SQ13698 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CACNA1SQ13698 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CACNA1SQ13698 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
CACNA1SQ13698 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
CACNA1SQ13698 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CACNA1SQ13698 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CACNA1SQ13698 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CACNA1SQ13698 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CACNA1SQ13698 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CACNA1SQ13698 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CACNA1SQ13698 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
CACNA1SQ13698 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CACNA1SQ13698 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CACNA1SQ13698 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CACNA1SQ13698 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CACNA1SQ13698 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CACNA1SQ13698 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CACNA1SQ13698 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CACNA1SQ13698 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
CACNA1SQ13698 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CACNA1SQ13698 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CACNA1SQ13698 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CACNA1SQ13698 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CACNA1SQ13698 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CACNA1SQ13698 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CACNA1SQ13698 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CACNA1SQ13698 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CACNA1SQ13698 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CACNA1SQ13698 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CACNA1SQ13698 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CACNA1SQ13698 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CACNA1SQ13698 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CACNA1SQ13698 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CACNA1SQ13698 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CACNA1SQ13698 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CACNA1SQ13698 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CACNA1SQ13698 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CACNA1SQ13698 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CACNA1SQ13698 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CACNA1SQ13698 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CACNA1SQ13698 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CACNA1SQ13698 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CACNA1SQ13698 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CACNA1SQ13698 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CACNA1SQ13698 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CACNA1SQ13698 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CACNA1SQ13698 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CACNA1SQ13698 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CACNA1SQ13698 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CACNA1SQ13698 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
CACNA1SQ13698 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CACNA1SQ13698 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CACNA1SQ13698 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CACNA1SQ13698 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CACNA1SQ13698 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CACNA1SQ13698 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CACNA1SQ13698 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CACNA1SQ13698 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CACNA1SQ13698 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CACNA1SQ13698 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CACNA1SQ13698 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CACNA1SQ13698 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CACNA1SQ13698 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CACNA1SQ13698 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CACNA1SQ13698 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CACNA1SQ13698 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CACNA1SQ13698 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
CACNA1SQ13698 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CACNA1SQ13698 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CACNA1SQ13698 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CACNA1SQ13698 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CACNA1SQ13698 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CACNA1SQ13698 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CACNA1SQ13698 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.82■■■□□ 2.53
CACNA1SQ13698 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CACNA1SQ13698 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CACNA1SQ13698 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CACNA1SQ13698 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CACNA1SQ13698 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CACNA1SQ13698 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
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