Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 PGAP2-237ENST00000534498 463 ntTSL 414.09□□□□□ -0.157e-8■■■■■ 41
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TARDBPQ13148 PGAP2-229ENST00000525937 654 ntTSL 313.75□□□□□ -0.217e-8■■■■■ 41
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TARDBPQ13148 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.317e-8■■■■■ 41
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TARDBPQ13148 PGAP2-219ENST00000479072 894 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.447e-8■■■■■ 41
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TARDBPQ13148 PGAP2-225ENST00000493547 1772 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.787e-8■■■■■ 41
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TARDBPQ13148 MARK3-209ENST00000555235 2282 ntTSL 215.37■□□□□ 0.053e-7■■■■■ 40.8
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TARDBPQ13148 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.524e-8■■■■■ 40.7
TARDBPQ13148 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.484e-8■■■■■ 40.7
TARDBPQ13148 QKI-208ENST00000537041 583 ntTSL 59.98□□□□□ -0.814e-8■■■■■ 40.7
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TARDBPQ13148 RUFY2-206ENST00000463210 405 ntTSL 37.17□□□□□ -1.266e-10■■■■■ 40.5
TARDBPQ13148 CHD9-204ENST00000561869 720 ntTSL 23.18□□□□□ -1.91e-11■■■■■ 40.5
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TARDBPQ13148 CCNY-208ENST00000492478 809 ntTSL 58.51□□□□□ -1.053e-8■■■■■ 40.4
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TARDBPQ13148 YME1L1-208ENST00000491542 912 ntTSL 214.74□□□□□ -0.053e-12■■■■■ 40.4
TARDBPQ13148 YME1L1-205ENST00000427324 775 ntTSL 36.95□□□□□ -1.33e-12■■■■■ 40.4
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TARDBPQ13148 RERE-211ENST00000469251 355 ntTSL 33.4□□□□□ -1.874e-7■■■■■ 40.3
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TARDBPQ13148 USP34-211ENST00000472706 556 ntTSL 45.12□□□□□ -1.593e-23■■■■■ 40.3
TARDBPQ13148 USP34-202ENST00000411912 4309 ntTSL 53.71□□□□□ -1.813e-23■■■■■ 40.3
TARDBPQ13148 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.094e-7■■■■■ 40.2
TARDBPQ13148 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.094e-7■■■■■ 40.2
TARDBPQ13148 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.974e-7■■■■■ 40.2
TARDBPQ13148 IGF2BP2-210ENST00000494906 918 ntTSL 58.77□□□□□ -1.016e-10■■■■■ 40.2
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TARDBPQ13148 HP1BP3-212ENST00000487117 1598 ntTSL 27.45□□□□□ -1.226e-11■■■■■ 40.1
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TARDBPQ13148 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.274e-13■■■■■ 40
TARDBPQ13148 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.364e-13■■■■■ 40
TARDBPQ13148 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.698e-7■■■■■ 40
TARDBPQ13148 RANBP1-207ENST00000423859 832 ntTSL 318.29■□□□□ 0.528e-7■■■■■ 40
TARDBPQ13148 RANBP1-210ENST00000435265 1879 ntTSL 218.18■□□□□ 0.58e-7■■■■■ 40
TARDBPQ13148 RANBP1-205ENST00000418705 932 ntTSL 316.75■□□□□ 0.278e-7■■■■■ 40
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