Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
STRN3Q13033 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
STRN3Q13033 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
STRN3Q13033 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
STRN3Q13033 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
STRN3Q13033 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
STRN3Q13033 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
STRN3Q13033 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
STRN3Q13033 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
STRN3Q13033 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
STRN3Q13033 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
STRN3Q13033 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
STRN3Q13033 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
STRN3Q13033 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
STRN3Q13033 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
STRN3Q13033 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
STRN3Q13033 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
STRN3Q13033 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
STRN3Q13033 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
STRN3Q13033 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
STRN3Q13033 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
STRN3Q13033 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
STRN3Q13033 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
STRN3Q13033 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRN3Q13033 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRN3Q13033 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRN3Q13033 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRN3Q13033 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRN3Q13033 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRN3Q13033 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRN3Q13033 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRN3Q13033 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRN3Q13033 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRN3Q13033 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
STRN3Q13033 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRN3Q13033 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
STRN3Q13033 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRN3Q13033 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
STRN3Q13033 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRN3Q13033 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRN3Q13033 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
STRN3Q13033 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
STRN3Q13033 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
STRN3Q13033 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
STRN3Q13033 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
STRN3Q13033 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
STRN3Q13033 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
STRN3Q13033 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
STRN3Q13033 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
STRN3Q13033 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
STRN3Q13033 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
STRN3Q13033 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
STRN3Q13033 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
STRN3Q13033 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STRN3Q13033 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STRN3Q13033 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
STRN3Q13033 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
STRN3Q13033 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
STRN3Q13033 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
STRN3Q13033 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STRN3Q13033 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRN3Q13033 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRN3Q13033 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRN3Q13033 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRN3Q13033 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRN3Q13033 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRN3Q13033 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
STRN3Q13033 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRN3Q13033 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRN3Q13033 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRN3Q13033 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRN3Q13033 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRN3Q13033 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRN3Q13033 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRN3Q13033 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
STRN3Q13033 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRN3Q13033 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
STRN3Q13033 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRN3Q13033 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRN3Q13033 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRN3Q13033 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRN3Q13033 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRN3Q13033 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRN3Q13033 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRN3Q13033 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRN3Q13033 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRN3Q13033 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRN3Q13033 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRN3Q13033 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRN3Q13033 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRN3Q13033 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRN3Q13033 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRN3Q13033 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRN3Q13033 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRN3Q13033 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
STRN3Q13033 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRN3Q13033 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRN3Q13033 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRN3Q13033 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STRN3Q13033 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms