Protein–RNA interactions for Protein: Q12849

GRSF1, G-rich sequence factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRSF1Q12849 ASPHD1-204ENST00000563177 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 520.94■□□□□ 0.942e-6■■■□□ 18.3
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GRSF1Q12849 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.463e-8■■■□□ 18.3
GRSF1Q12849 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.283e-8■■■□□ 18.3
GRSF1Q12849 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.864e-14■■■□□ 18.2
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GRSF1Q12849 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.311e-7■■■□□ 18.1
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GRSF1Q12849 BTBD7-202ENST00000334746 8430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.833e-8■■■□□ 17.8
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GRSF1Q12849 TRAPPC2L-209ENST00000565205 1084 ntTSL 1 (best)13.64□□□□□ -0.231e-7■■■□□ 17.8
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GRSF1Q12849 TRAPPC2L-205ENST00000563514 419 ntTSL 213.5□□□□□ -0.251e-7■■■□□ 17.8
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GRSF1Q12849 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.361e-7■■■□□ 17.8
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GRSF1Q12849 TRAPPC2L-214ENST00000568583 801 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.451e-7■■■□□ 17.8
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GRSF1Q12849 ZNF358-201ENST00000596712 662 ntTSL 317.26■□□□□ 0.351e-7■■■□□ 17.7
GRSF1Q12849 AC008878.1-201ENST00000597384 634 ntTSL 311.58□□□□□ -0.561e-7■■■□□ 17.7
GRSF1Q12849 AC008878.1-202ENST00000599312 382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.641e-7■■■□□ 17.7
GRSF1Q12849 DHRS2-206ENST00000556550 2595 nt13.81□□□□□ -0.22e-16■■■□□ 17.6
GRSF1Q12849 PGPEP1-207ENST00000597663 363 ntTSL 316.33■□□□□ 0.21e-8■■■□□ 17.6
GRSF1Q12849 PGPEP1-204ENST00000595552 418 ntTSL 211.24□□□□□ -0.611e-8■■■□□ 17.6
GRSF1Q12849 PGPEP1-202ENST00000269919 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.611e-8■■■□□ 17.6
GRSF1Q12849 RETREG3-208ENST00000589797 4149 ntTSL 214.05□□□□□ -0.169e-9■■■□□ 17.6
GRSF1Q12849 RETREG3-201ENST00000309428 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.469e-9■■■□□ 17.6
GRSF1Q12849 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.333e-9■■■□□ 17.5
GRSF1Q12849 GYG2-208ENST00000520904 624 ntTSL 322.08■■□□□ 1.133e-9■■■□□ 17.5
GRSF1Q12849 GYG2-204ENST00000381163 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.363e-9■■■□□ 17.5
GRSF1Q12849 GYG2-203ENST00000381161 2852 ntTSL 211.64□□□□□ -0.553e-9■■■□□ 17.5
GRSF1Q12849 FAM214A-203ENST00000534964 4590 ntTSL 215.81■□□□□ 0.123e-6■■■□□ 17.5
GRSF1Q12849 FAM214A-207ENST00000562135 581 ntTSL 58.43□□□□□ -1.063e-6■■■□□ 17.5
GRSF1Q12849 FAM214A-202ENST00000399202 3048 ntTSL 1 (best)7.06□□□□□ -1.283e-6■■■□□ 17.5
GRSF1Q12849 C20orf27-203ENST00000399672 1734 ntAPPRIS P1 TSL 225.19■■□□□ 1.623e-7■■■□□ 17.5
GRSF1Q12849 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.343e-7■■■□□ 17.5
GRSF1Q12849 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.923e-7■■■□□ 17.5
GRSF1Q12849 C20orf27-204ENST00000399683 933 ntTSL 216.89■□□□□ 0.293e-7■■■□□ 17.5
GRSF1Q12849 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.982e-8■■■□□ 17.5
GRSF1Q12849 CARHSP1-215ENST00000570125 681 ntTSL 429.79■■■□□ 2.363e-7■■■□□ 17.4
GRSF1Q12849 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.633e-7■■■□□ 17.4
GRSF1Q12849 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.623e-7■■■□□ 17.4
GRSF1Q12849 CARHSP1-206ENST00000563815 1913 ntTSL 218.85■□□□□ 0.613e-7■■■□□ 17.4
GRSF1Q12849 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.423e-7■■■□□ 17.4
GRSF1Q12849 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.043e-7■■■□□ 17.4
GRSF1Q12849 CARHSP1-211ENST00000568117 521 ntTSL 315.05■□□□□ -03e-7■■■□□ 17.4
GRSF1Q12849 CARHSP1-210ENST00000567908 565 ntTSL 214.76□□□□□ -0.053e-7■■■□□ 17.4
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