Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 TRS31YDR472W 852 nt6.79□□□□□ -1.32
UBX3Q12229 MTR3YGR158C 753 nt6.79□□□□□ -1.32
UBX3Q12229 REC107YJR021C 945 nt6.79□□□□□ -1.32
UBX3Q12229 SPG5YMR191W 1122 nt6.79□□□□□ -1.32
UBX3Q12229 SLA2YNL243W 2907 nt6.78□□□□□ -1.32
UBX3Q12229 NDE1YMR145C 1683 nt6.78□□□□□ -1.32
UBX3Q12229 MCH2YKL221W 1422 nt6.78□□□□□ -1.32
UBX3Q12229 VBA5YKR105C 1749 nt6.78□□□□□ -1.32
UBX3Q12229 CCT3YJL014W 1605 nt6.77□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 MRPL28YDR462W 444 nt6.77□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 YJL163CYJL163C 1668 nt6.77□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 CMK2YOL016C 1344 nt6.76□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 SEC23YPR181C 2307 nt6.76□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 MCP1YOR228C 909 nt6.76□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 GFA1YKL104C 2154 nt6.76□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 TUF1YOR187W 1314 nt6.76□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 EFM1YHL039W 1758 nt6.75□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 PAC2YER007W 1557 nt6.75□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 ERS1YCR075C 783 nt6.75□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 MRPS28YDR337W 861 nt6.75□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 IDP3YNL009W 1263 nt6.75□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 ARC35YNR035C 1029 nt6.75□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 FIT2YOR382W 462 nt6.75□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 HOG1YLR113W 1308 nt6.75□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt6.74□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 RPL31BYLR406C 342 nt6.74□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 YOL046CYOL046C 675 nt6.74□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 HBN1YCL026C-B 582 nt6.74□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 EHD3YDR036C 1503 nt6.74□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 GSH1YJL101C 2037 nt6.74□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 SRF1YDL133W 1314 nt6.74□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 TAH11YJR046W 1815 nt6.73□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 PTC7YHR076W 1032 nt6.73□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 COS10YNR075W 1125 nt6.73□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 ERG10YPL028W 1197 nt6.73□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 AFG2YLR397C 2343 nt6.73□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 CIT3YPR001W 1461 nt6.73□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 CYB2YML054C 1776 nt6.72□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 CTF3YLR381W 2202 nt6.72□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 HEL1YKR017C 1656 nt6.72□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 MIP1YOR330C 3765 nt6.72□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 URH1YDR400W 1023 nt6.72□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 YGL102CYGL102C 429 nt6.72□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 CBR1YIL043C 855 nt6.72□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 PRI1YIR008C 1230 nt6.72□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 NTG1YAL015C 1200 nt6.72□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 LGE1YPL055C 999 nt6.72□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 KIN1YDR122W 3195 nt6.72□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 ICP55YER078C 1536 nt6.71□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 MSC3YLR219W 2187 nt6.71□□□□□ -1.33
UBX3Q12229 PPS1YBR276C 2424 nt6.71□□□□□ -1.34
UBX3Q12229 RGD2YFL047W 2145 nt6.71□□□□□ -1.34
UBX3Q12229 CCR4YAL021C 2514 nt6.71□□□□□ -1.34
UBX3Q12229 NUP49YGL172W 1419 nt6.7□□□□□ -1.34
UBX3Q12229 SMX3YPR182W 261 nt6.7□□□□□ -1.34
UBX3Q12229 YBR241CYBR241C 1467 nt6.7□□□□□ -1.34
UBX3Q12229 SHO1YER118C 1104 nt6.69□□□□□ -1.34
UBX3Q12229 URA1YKL216W 945 nt6.69□□□□□ -1.34
UBX3Q12229 RDN5-2RDN5-2 119 nt6.69□□□□□ -1.34
UBX3Q12229 RDN5-3RDN5-3 119 nt6.69□□□□□ -1.34
UBX3Q12229 RDN5-4RDN5-4 119 nt6.69□□□□□ -1.34
UBX3Q12229 RDN5-5RDN5-5 119 nt6.69□□□□□ -1.34
UBX3Q12229 YPR076WYPR076W 375 nt6.69□□□□□ -1.34
UBX3Q12229 MPH3YJR160C 1809 nt6.69□□□□□ -1.34
UBX3Q12229 AGX1YFL030W 1158 nt6.68□□□□□ -1.34
UBX3Q12229 SEC62YPL094C 825 nt6.68□□□□□ -1.34
UBX3Q12229 SPE3YPR069C 882 nt6.68□□□□□ -1.34
UBX3Q12229 BIO3YNR058W 1443 nt6.67□□□□□ -1.34
UBX3Q12229 YSC83YHR017W 1158 nt6.67□□□□□ -1.34
UBX3Q12229 YLL056CYLL056C 897 nt6.67□□□□□ -1.34
UBX3Q12229 YNR014WYNR014W 639 nt6.67□□□□□ -1.34
UBX3Q12229 YOS9YDR057W 1629 nt6.67□□□□□ -1.34
UBX3Q12229 ASN2YGR124W 1719 nt6.67□□□□□ -1.34
UBX3Q12229 COX15YER141W 1461 nt6.66□□□□□ -1.34
UBX3Q12229 YDL177CYDL177C 513 nt6.66□□□□□ -1.34
UBX3Q12229 YJL144WYJL144W 315 nt6.66□□□□□ -1.34
UBX3Q12229 LDB7YBL006C 543 nt6.66□□□□□ -1.34
UBX3Q12229 PUS4YNL292W 1212 nt6.66□□□□□ -1.34
UBX3Q12229 AAD14YNL331C 1131 nt6.66□□□□□ -1.34
UBX3Q12229 YBR226CYBR226C 411 nt6.66□□□□□ -1.34
UBX3Q12229 ASR1YPR093C 867 nt6.65□□□□□ -1.34
UBX3Q12229 YMR034CYMR034C 1305 nt6.65□□□□□ -1.35
UBX3Q12229 RGT2YDL138W 2292 nt6.64□□□□□ -1.35
UBX3Q12229 PPH21YDL134C 1110 nt6.64□□□□□ -1.35
UBX3Q12229 RPL2BYIL018W 765 nt6.64□□□□□ -1.35
UBX3Q12229 REG2YBR050C 1017 nt6.64□□□□□ -1.35
UBX3Q12229 PPH22YDL188C 1134 nt6.63□□□□□ -1.35
UBX3Q12229 DOT1YDR440W 1749 nt6.63□□□□□ -1.35
UBX3Q12229 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.63□□□□□ -1.35
UBX3Q12229 GPA1YHR005C 1419 nt6.63□□□□□ -1.35
UBX3Q12229 CDC16YKL022C 2523 nt6.63□□□□□ -1.35
UBX3Q12229 YLL066CYLL066C 3618 nt6.63□□□□□ -1.35
UBX3Q12229 IRC11YOR013W 471 nt6.63□□□□□ -1.35
UBX3Q12229 YHR020WYHR020W 2067 nt6.62□□□□□ -1.35
UBX3Q12229 COX16YJL003W 357 nt6.62□□□□□ -1.35
UBX3Q12229 MRPL19YNL185C 477 nt6.62□□□□□ -1.35
UBX3Q12229 PLB3YOL011W 2061 nt6.61□□□□□ -1.35
UBX3Q12229 SSC1YJR045C 1965 nt6.61□□□□□ -1.35
UBX3Q12229 MAK32YCR019W 1092 nt6.61□□□□□ -1.35
UBX3Q12229 HED1YDR014W-A 489 nt6.61□□□□□ -1.35
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