Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPN12Q05209 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPN12Q05209 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPN12Q05209 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPN12Q05209 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPN12Q05209 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPN12Q05209 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPN12Q05209 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPN12Q05209 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPN12Q05209 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPN12Q05209 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPN12Q05209 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPN12Q05209 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPN12Q05209 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPN12Q05209 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPN12Q05209 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPN12Q05209 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPN12Q05209 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPN12Q05209 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPN12Q05209 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPN12Q05209 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPN12Q05209 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPN12Q05209 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPN12Q05209 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PTPN12Q05209 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
PTPN12Q05209 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
PTPN12Q05209 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTPN12Q05209 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPN12Q05209 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPN12Q05209 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPN12Q05209 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPN12Q05209 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPN12Q05209 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPN12Q05209 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPN12Q05209 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPN12Q05209 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPN12Q05209 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPN12Q05209 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPN12Q05209 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPN12Q05209 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPN12Q05209 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPN12Q05209 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPN12Q05209 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPN12Q05209 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPN12Q05209 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTPN12Q05209 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTPN12Q05209 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTPN12Q05209 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
PTPN12Q05209 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPN12Q05209 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPN12Q05209 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPN12Q05209 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPN12Q05209 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPN12Q05209 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPN12Q05209 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPN12Q05209 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPN12Q05209 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPN12Q05209 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPN12Q05209 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPN12Q05209 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPN12Q05209 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPN12Q05209 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPN12Q05209 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPN12Q05209 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPN12Q05209 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPN12Q05209 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPN12Q05209 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPN12Q05209 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPN12Q05209 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPN12Q05209 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPN12Q05209 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPN12Q05209 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPN12Q05209 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPN12Q05209 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPN12Q05209 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPN12Q05209 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPN12Q05209 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPN12Q05209 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPN12Q05209 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPN12Q05209 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPN12Q05209 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPN12Q05209 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPN12Q05209 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPN12Q05209 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPN12Q05209 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPN12Q05209 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPN12Q05209 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPN12Q05209 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPN12Q05209 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPN12Q05209 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPN12Q05209 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPN12Q05209 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPN12Q05209 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPN12Q05209 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPN12Q05209 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPN12Q05209 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPN12Q05209 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPN12Q05209 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPN12Q05209 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPN12Q05209 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms