Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MUC3AQ02505 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MUC3AQ02505 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MUC3AQ02505 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MUC3AQ02505 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MUC3AQ02505 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MUC3AQ02505 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MUC3AQ02505 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MUC3AQ02505 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MUC3AQ02505 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MUC3AQ02505 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MUC3AQ02505 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MUC3AQ02505 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MUC3AQ02505 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MUC3AQ02505 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MUC3AQ02505 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MUC3AQ02505 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MUC3AQ02505 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MUC3AQ02505 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MUC3AQ02505 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MUC3AQ02505 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MUC3AQ02505 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MUC3AQ02505 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MUC3AQ02505 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MUC3AQ02505 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MUC3AQ02505 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MUC3AQ02505 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MUC3AQ02505 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MUC3AQ02505 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MUC3AQ02505 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MUC3AQ02505 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MUC3AQ02505 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MUC3AQ02505 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MUC3AQ02505 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MUC3AQ02505 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MUC3AQ02505 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MUC3AQ02505 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MUC3AQ02505 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MUC3AQ02505 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MUC3AQ02505 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MUC3AQ02505 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MUC3AQ02505 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MUC3AQ02505 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MUC3AQ02505 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MUC3AQ02505 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MUC3AQ02505 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MUC3AQ02505 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MUC3AQ02505 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MUC3AQ02505 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MUC3AQ02505 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MUC3AQ02505 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MUC3AQ02505 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MUC3AQ02505 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MUC3AQ02505 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MUC3AQ02505 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MUC3AQ02505 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MUC3AQ02505 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MUC3AQ02505 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MUC3AQ02505 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MUC3AQ02505 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MUC3AQ02505 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MUC3AQ02505 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MUC3AQ02505 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MUC3AQ02505 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MUC3AQ02505 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MUC3AQ02505 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MUC3AQ02505 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MUC3AQ02505 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MUC3AQ02505 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MUC3AQ02505 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MUC3AQ02505 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MUC3AQ02505 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MUC3AQ02505 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MUC3AQ02505 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MUC3AQ02505 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MUC3AQ02505 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MUC3AQ02505 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MUC3AQ02505 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MUC3AQ02505 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MUC3AQ02505 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MUC3AQ02505 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MUC3AQ02505 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MUC3AQ02505 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MUC3AQ02505 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MUC3AQ02505 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MUC3AQ02505 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MUC3AQ02505 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MUC3AQ02505 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MUC3AQ02505 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MUC3AQ02505 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MUC3AQ02505 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MUC3AQ02505 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MUC3AQ02505 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MUC3AQ02505 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MUC3AQ02505 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MUC3AQ02505 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MUC3AQ02505 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MUC3AQ02505 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MUC3AQ02505 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MUC3AQ02505 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms