Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1DQ01668 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1DQ01668 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1DQ01668 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1DQ01668 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1DQ01668 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1DQ01668 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1DQ01668 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1DQ01668 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1DQ01668 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1DQ01668 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1DQ01668 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1DQ01668 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1DQ01668 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1DQ01668 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1DQ01668 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1DQ01668 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1DQ01668 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1DQ01668 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1DQ01668 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1DQ01668 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1DQ01668 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1DQ01668 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1DQ01668 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1DQ01668 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1DQ01668 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1DQ01668 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNA1DQ01668 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1DQ01668 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms