Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBP5P82980 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBP5P82980 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RBP5P82980 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RBP5P82980 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBP5P82980 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBP5P82980 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RBP5P82980 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RBP5P82980 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RBP5P82980 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RBP5P82980 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RBP5P82980 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RBP5P82980 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RBP5P82980 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RBP5P82980 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RBP5P82980 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RBP5P82980 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RBP5P82980 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RBP5P82980 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBP5P82980 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBP5P82980 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBP5P82980 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBP5P82980 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBP5P82980 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RBP5P82980 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBP5P82980 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RBP5P82980 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RBP5P82980 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RBP5P82980 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RBP5P82980 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RBP5P82980 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RBP5P82980 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RBP5P82980 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RBP5P82980 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RBP5P82980 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RBP5P82980 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RBP5P82980 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RBP5P82980 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RBP5P82980 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RBP5P82980 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RBP5P82980 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RBP5P82980 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RBP5P82980 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RBP5P82980 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RBP5P82980 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RBP5P82980 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RBP5P82980 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RBP5P82980 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RBP5P82980 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBP5P82980 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBP5P82980 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RBP5P82980 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBP5P82980 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBP5P82980 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBP5P82980 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBP5P82980 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBP5P82980 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBP5P82980 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBP5P82980 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RBP5P82980 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RBP5P82980 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RBP5P82980 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RBP5P82980 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RBP5P82980 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RBP5P82980 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBP5P82980 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBP5P82980 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBP5P82980 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBP5P82980 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBP5P82980 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBP5P82980 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBP5P82980 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBP5P82980 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBP5P82980 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBP5P82980 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBP5P82980 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBP5P82980 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBP5P82980 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBP5P82980 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBP5P82980 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBP5P82980 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBP5P82980 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBP5P82980 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBP5P82980 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBP5P82980 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBP5P82980 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBP5P82980 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RBP5P82980 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBP5P82980 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RBP5P82980 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBP5P82980 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBP5P82980 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBP5P82980 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBP5P82980 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBP5P82980 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBP5P82980 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBP5P82980 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBP5P82980 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBP5P82980 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBP5P82980 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms