Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IRX3P78415 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IRX3P78415 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
IRX3P78415 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IRX3P78415 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IRX3P78415 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IRX3P78415 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IRX3P78415 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IRX3P78415 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IRX3P78415 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IRX3P78415 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IRX3P78415 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IRX3P78415 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IRX3P78415 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
IRX3P78415 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IRX3P78415 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IRX3P78415 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IRX3P78415 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IRX3P78415 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
IRX3P78415 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IRX3P78415 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IRX3P78415 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
IRX3P78415 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IRX3P78415 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IRX3P78415 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
IRX3P78415 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IRX3P78415 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IRX3P78415 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IRX3P78415 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
IRX3P78415 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IRX3P78415 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IRX3P78415 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IRX3P78415 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IRX3P78415 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IRX3P78415 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IRX3P78415 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IRX3P78415 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IRX3P78415 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IRX3P78415 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IRX3P78415 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IRX3P78415 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
IRX3P78415 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IRX3P78415 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
IRX3P78415 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
IRX3P78415 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IRX3P78415 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IRX3P78415 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IRX3P78415 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IRX3P78415 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
IRX3P78415 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IRX3P78415 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IRX3P78415 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IRX3P78415 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IRX3P78415 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
IRX3P78415 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
IRX3P78415 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
IRX3P78415 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
IRX3P78415 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
IRX3P78415 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
IRX3P78415 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IRX3P78415 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IRX3P78415 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IRX3P78415 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IRX3P78415 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IRX3P78415 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IRX3P78415 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IRX3P78415 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
IRX3P78415 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
IRX3P78415 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
IRX3P78415 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
IRX3P78415 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
IRX3P78415 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
IRX3P78415 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
IRX3P78415 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
IRX3P78415 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
IRX3P78415 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IRX3P78415 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IRX3P78415 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IRX3P78415 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
IRX3P78415 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
IRX3P78415 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
IRX3P78415 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
IRX3P78415 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
IRX3P78415 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
IRX3P78415 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
IRX3P78415 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
IRX3P78415 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
IRX3P78415 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
IRX3P78415 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
IRX3P78415 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
IRX3P78415 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IRX3P78415 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IRX3P78415 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IRX3P78415 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IRX3P78415 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
IRX3P78415 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IRX3P78415 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IRX3P78415 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IRX3P78415 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IRX3P78415 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms