Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS4XP62701 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS4XP62701 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS4XP62701 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS4XP62701 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS4XP62701 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS4XP62701 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS4XP62701 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS4XP62701 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS4XP62701 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS4XP62701 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS4XP62701 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS4XP62701 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS4XP62701 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS4XP62701 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS4XP62701 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS4XP62701 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS4XP62701 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS4XP62701 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS4XP62701 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS4XP62701 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS4XP62701 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS4XP62701 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS4XP62701 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS4XP62701 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS4XP62701 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS4XP62701 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS4XP62701 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS4XP62701 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS4XP62701 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS4XP62701 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS4XP62701 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS4XP62701 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS4XP62701 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS4XP62701 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS4XP62701 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS4XP62701 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS4XP62701 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS4XP62701 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS4XP62701 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS4XP62701 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS4XP62701 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS4XP62701 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS4XP62701 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS4XP62701 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS4XP62701 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS4XP62701 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS4XP62701 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS4XP62701 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS4XP62701 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RPS4XP62701 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS4XP62701 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS4XP62701 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS4XP62701 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS4XP62701 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS4XP62701 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS4XP62701 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS4XP62701 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms