Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SNRPFP62306 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNRPFP62306 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNRPFP62306 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNRPFP62306 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNRPFP62306 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNRPFP62306 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNRPFP62306 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNRPFP62306 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNRPFP62306 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNRPFP62306 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNRPFP62306 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNRPFP62306 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNRPFP62306 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNRPFP62306 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNRPFP62306 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNRPFP62306 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNRPFP62306 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNRPFP62306 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNRPFP62306 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNRPFP62306 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNRPFP62306 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SNRPFP62306 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNRPFP62306 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNRPFP62306 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNRPFP62306 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNRPFP62306 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNRPFP62306 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNRPFP62306 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNRPFP62306 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SNRPFP62306 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNRPFP62306 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNRPFP62306 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNRPFP62306 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNRPFP62306 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SNRPFP62306 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNRPFP62306 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNRPFP62306 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNRPFP62306 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNRPFP62306 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNRPFP62306 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNRPFP62306 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNRPFP62306 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNRPFP62306 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNRPFP62306 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNRPFP62306 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNRPFP62306 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNRPFP62306 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNRPFP62306 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNRPFP62306 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNRPFP62306 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNRPFP62306 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNRPFP62306 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNRPFP62306 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNRPFP62306 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SNRPFP62306 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNRPFP62306 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SNRPFP62306 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNRPFP62306 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNRPFP62306 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNRPFP62306 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNRPFP62306 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNRPFP62306 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNRPFP62306 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNRPFP62306 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNRPFP62306 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNRPFP62306 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNRPFP62306 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNRPFP62306 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNRPFP62306 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNRPFP62306 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNRPFP62306 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNRPFP62306 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNRPFP62306 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNRPFP62306 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNRPFP62306 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNRPFP62306 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNRPFP62306 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNRPFP62306 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNRPFP62306 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNRPFP62306 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNRPFP62306 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNRPFP62306 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNRPFP62306 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNRPFP62306 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNRPFP62306 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SNRPFP62306 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SNRPFP62306 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SNRPFP62306 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SNRPFP62306 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SNRPFP62306 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNRPFP62306 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNRPFP62306 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SNRPFP62306 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNRPFP62306 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNRPFP62306 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNRPFP62306 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNRPFP62306 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SNRPFP62306 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNRPFP62306 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms