Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VBP1P61758 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VBP1P61758 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VBP1P61758 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VBP1P61758 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VBP1P61758 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VBP1P61758 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VBP1P61758 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VBP1P61758 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VBP1P61758 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VBP1P61758 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VBP1P61758 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VBP1P61758 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VBP1P61758 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VBP1P61758 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VBP1P61758 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VBP1P61758 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VBP1P61758 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VBP1P61758 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VBP1P61758 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VBP1P61758 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VBP1P61758 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VBP1P61758 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VBP1P61758 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VBP1P61758 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VBP1P61758 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VBP1P61758 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VBP1P61758 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VBP1P61758 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VBP1P61758 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VBP1P61758 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VBP1P61758 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VBP1P61758 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VBP1P61758 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VBP1P61758 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VBP1P61758 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VBP1P61758 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VBP1P61758 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VBP1P61758 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VBP1P61758 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VBP1P61758 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VBP1P61758 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VBP1P61758 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VBP1P61758 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VBP1P61758 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VBP1P61758 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VBP1P61758 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VBP1P61758 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VBP1P61758 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VBP1P61758 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VBP1P61758 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VBP1P61758 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VBP1P61758 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VBP1P61758 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VBP1P61758 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VBP1P61758 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VBP1P61758 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VBP1P61758 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VBP1P61758 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VBP1P61758 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VBP1P61758 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VBP1P61758 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VBP1P61758 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VBP1P61758 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VBP1P61758 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VBP1P61758 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VBP1P61758 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VBP1P61758 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VBP1P61758 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VBP1P61758 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VBP1P61758 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VBP1P61758 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VBP1P61758 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VBP1P61758 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VBP1P61758 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VBP1P61758 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VBP1P61758 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VBP1P61758 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VBP1P61758 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VBP1P61758 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VBP1P61758 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VBP1P61758 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VBP1P61758 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VBP1P61758 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VBP1P61758 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VBP1P61758 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VBP1P61758 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VBP1P61758 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VBP1P61758 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VBP1P61758 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VBP1P61758 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VBP1P61758 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VBP1P61758 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VBP1P61758 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VBP1P61758 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VBP1P61758 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VBP1P61758 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VBP1P61758 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VBP1P61758 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VBP1P61758 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms