Protein–RNA interactions for Protein: P58557

YBEY, Endoribonuclease YbeY, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBEYP58557 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
YBEYP58557 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
YBEYP58557 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
YBEYP58557 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
YBEYP58557 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
YBEYP58557 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
YBEYP58557 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
YBEYP58557 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
YBEYP58557 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
YBEYP58557 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
YBEYP58557 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
YBEYP58557 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
YBEYP58557 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
YBEYP58557 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
YBEYP58557 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
YBEYP58557 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
YBEYP58557 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
YBEYP58557 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
YBEYP58557 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
YBEYP58557 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
YBEYP58557 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
YBEYP58557 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
YBEYP58557 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
YBEYP58557 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
YBEYP58557 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
YBEYP58557 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
YBEYP58557 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
YBEYP58557 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
YBEYP58557 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
YBEYP58557 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
YBEYP58557 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
YBEYP58557 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
YBEYP58557 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
YBEYP58557 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
YBEYP58557 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
YBEYP58557 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
YBEYP58557 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
YBEYP58557 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
YBEYP58557 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
YBEYP58557 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
YBEYP58557 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
YBEYP58557 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
YBEYP58557 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
YBEYP58557 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
YBEYP58557 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
YBEYP58557 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
YBEYP58557 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
YBEYP58557 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
YBEYP58557 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
YBEYP58557 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
YBEYP58557 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
YBEYP58557 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
YBEYP58557 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
YBEYP58557 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
YBEYP58557 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
YBEYP58557 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
YBEYP58557 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
YBEYP58557 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
YBEYP58557 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YBEYP58557 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
YBEYP58557 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YBEYP58557 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
YBEYP58557 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
YBEYP58557 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YBEYP58557 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YBEYP58557 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YBEYP58557 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
YBEYP58557 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
YBEYP58557 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
YBEYP58557 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
YBEYP58557 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
YBEYP58557 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
YBEYP58557 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
YBEYP58557 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
YBEYP58557 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
YBEYP58557 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
YBEYP58557 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
YBEYP58557 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
YBEYP58557 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
YBEYP58557 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
YBEYP58557 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
YBEYP58557 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
YBEYP58557 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
YBEYP58557 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
YBEYP58557 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
YBEYP58557 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
YBEYP58557 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
YBEYP58557 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
YBEYP58557 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
YBEYP58557 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
YBEYP58557 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
YBEYP58557 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
YBEYP58557 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
YBEYP58557 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
YBEYP58557 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
YBEYP58557 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
YBEYP58557 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
YBEYP58557 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
YBEYP58557 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
YBEYP58557 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms