Protein–RNA interactions for Protein: P56199

ITGA1, Integrin alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA1P56199 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA1P56199 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA1P56199 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA1P56199 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA1P56199 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA1P56199 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA1P56199 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ITGA1P56199 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ITGA1P56199 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA1P56199 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA1P56199 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA1P56199 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA1P56199 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA1P56199 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA1P56199 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA1P56199 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA1P56199 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA1P56199 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA1P56199 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA1P56199 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA1P56199 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA1P56199 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA1P56199 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA1P56199 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA1P56199 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA1P56199 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA1P56199 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA1P56199 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA1P56199 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA1P56199 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA1P56199 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA1P56199 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA1P56199 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA1P56199 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA1P56199 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGA1P56199 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA1P56199 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA1P56199 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA1P56199 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA1P56199 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA1P56199 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA1P56199 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA1P56199 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA1P56199 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA1P56199 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA1P56199 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA1P56199 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA1P56199 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA1P56199 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA1P56199 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA1P56199 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA1P56199 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA1P56199 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA1P56199 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA1P56199 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA1P56199 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA1P56199 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA1P56199 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA1P56199 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA1P56199 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA1P56199 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms