Protein–RNA interactions for Protein: P55289

CDH12, Cadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH12P55289 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH12P55289 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH12P55289 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH12P55289 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH12P55289 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH12P55289 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH12P55289 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH12P55289 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH12P55289 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH12P55289 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH12P55289 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH12P55289 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH12P55289 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH12P55289 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH12P55289 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH12P55289 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH12P55289 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH12P55289 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH12P55289 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH12P55289 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH12P55289 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH12P55289 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH12P55289 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH12P55289 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH12P55289 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH12P55289 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH12P55289 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH12P55289 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH12P55289 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH12P55289 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH12P55289 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH12P55289 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH12P55289 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH12P55289 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH12P55289 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDH12P55289 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDH12P55289 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH12P55289 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH12P55289 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH12P55289 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH12P55289 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH12P55289 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH12P55289 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH12P55289 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH12P55289 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH12P55289 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH12P55289 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH12P55289 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH12P55289 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH12P55289 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH12P55289 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH12P55289 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH12P55289 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH12P55289 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH12P55289 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH12P55289 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH12P55289 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH12P55289 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH12P55289 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH12P55289 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH12P55289 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH12P55289 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH12P55289 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH12P55289 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH12P55289 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH12P55289 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH12P55289 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH12P55289 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH12P55289 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH12P55289 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH12P55289 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH12P55289 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH12P55289 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH12P55289 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH12P55289 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDH12P55289 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
CDH12P55289 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH12P55289 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH12P55289 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH12P55289 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH12P55289 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH12P55289 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH12P55289 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH12P55289 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH12P55289 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH12P55289 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH12P55289 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH12P55289 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH12P55289 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH12P55289 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH12P55289 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH12P55289 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH12P55289 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH12P55289 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH12P55289 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH12P55289 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH12P55289 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH12P55289 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH12P55289 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH12P55289 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms