Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NAP1L1P55209 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NAP1L1P55209 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NAP1L1P55209 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NAP1L1P55209 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NAP1L1P55209 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NAP1L1P55209 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NAP1L1P55209 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NAP1L1P55209 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NAP1L1P55209 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NAP1L1P55209 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NAP1L1P55209 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NAP1L1P55209 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NAP1L1P55209 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NAP1L1P55209 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NAP1L1P55209 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NAP1L1P55209 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NAP1L1P55209 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NAP1L1P55209 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NAP1L1P55209 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NAP1L1P55209 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NAP1L1P55209 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NAP1L1P55209 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NAP1L1P55209 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NAP1L1P55209 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NAP1L1P55209 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NAP1L1P55209 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NAP1L1P55209 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NAP1L1P55209 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NAP1L1P55209 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NAP1L1P55209 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NAP1L1P55209 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NAP1L1P55209 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NAP1L1P55209 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NAP1L1P55209 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NAP1L1P55209 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NAP1L1P55209 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NAP1L1P55209 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NAP1L1P55209 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NAP1L1P55209 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NAP1L1P55209 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NAP1L1P55209 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NAP1L1P55209 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NAP1L1P55209 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NAP1L1P55209 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NAP1L1P55209 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NAP1L1P55209 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NAP1L1P55209 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NAP1L1P55209 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NAP1L1P55209 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NAP1L1P55209 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NAP1L1P55209 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NAP1L1P55209 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NAP1L1P55209 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NAP1L1P55209 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NAP1L1P55209 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NAP1L1P55209 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NAP1L1P55209 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NAP1L1P55209 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NAP1L1P55209 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NAP1L1P55209 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms