Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA2D1P54289 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNA2D1P54289 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA2D1P54289 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA2D1P54289 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA2D1P54289 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNA2D1P54289 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNA2D1P54289 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNA2D1P54289 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNA2D1P54289 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNA2D1P54289 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNA2D1P54289 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNA2D1P54289 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNA2D1P54289 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNA2D1P54289 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNA2D1P54289 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNA2D1P54289 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA2D1P54289 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA2D1P54289 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA2D1P54289 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA2D1P54289 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA2D1P54289 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA2D1P54289 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CACNA2D1P54289 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CACNA2D1P54289 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNA2D1P54289 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNA2D1P54289 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNA2D1P54289 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNA2D1P54289 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNA2D1P54289 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA2D1P54289 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA2D1P54289 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA2D1P54289 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA2D1P54289 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA2D1P54289 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA2D1P54289 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA2D1P54289 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNA2D1P54289 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNA2D1P54289 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNA2D1P54289 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNA2D1P54289 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNA2D1P54289 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNA2D1P54289 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNA2D1P54289 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNA2D1P54289 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNA2D1P54289 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNA2D1P54289 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNA2D1P54289 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA2D1P54289 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA2D1P54289 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA2D1P54289 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA2D1P54289 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA2D1P54289 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNA2D1P54289 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNA2D1P54289 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA2D1P54289 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA2D1P54289 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA2D1P54289 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA2D1P54289 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA2D1P54289 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA2D1P54289 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA2D1P54289 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA2D1P54289 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA2D1P54289 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA2D1P54289 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA2D1P54289 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA2D1P54289 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA2D1P54289 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA2D1P54289 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA2D1P54289 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA2D1P54289 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA2D1P54289 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA2D1P54289 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA2D1P54289 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNA2D1P54289 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNA2D1P54289 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNA2D1P54289 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNA2D1P54289 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNA2D1P54289 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA2D1P54289 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA2D1P54289 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA2D1P54289 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA2D1P54289 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA2D1P54289 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA2D1P54289 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA2D1P54289 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA2D1P54289 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNA2D1P54289 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNA2D1P54289 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNA2D1P54289 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA2D1P54289 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA2D1P54289 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA2D1P54289 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA2D1P54289 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA2D1P54289 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA2D1P54289 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA2D1P54289 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA2D1P54289 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA2D1P54289 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA2D1P54289 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms