Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 MRPL11-202ENST00000329819 922 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.852e-6■■■■■ 53.2
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SUB1P53999 MRPL11-205ENST00000528272 506 ntTSL 34.54□□□□□ -1.682e-6■■■■■ 53.2
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SUB1P53999 HSPH1-203ENST00000435381 812 ntTSL 42.39□□□□□ -2.033e-8■■■■■ 52.9
SUB1P53999 PSMB7-201ENST00000259457 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.23e-8■■■■■ 52.9
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SUB1P53999 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.631e-7■■■■■ 52.6
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SUB1P53999 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.22e-24■■■■■ 52.2
SUB1P53999 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.232e-24■■■■■ 52.2
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SUB1P53999 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.431e-25■■■■■ 52.1
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SUB1P53999 HNRNPA2B1-201ENST00000354667 3664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.387e-9■■■■■ 51.2
SUB1P53999 SRSF7-212ENST00000487773 637 ntTSL 53.51□□□□□ -1.857e-39■■■■■ 51.2
SUB1P53999 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.442e-10■■■■■ 51.2
SUB1P53999 C4orf3-201ENST00000399075 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.942e-10■■■■■ 51.2
SUB1P53999 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.472e-14■■■■■ 50.9
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SUB1P53999 RPL15-210ENST00000456530 2835 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.952e-14■■■■■ 50.9
SUB1P53999 RPL15-204ENST00000413699 2053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.032e-14■■■■■ 50.9
SUB1P53999 RPL15-209ENST00000436146 1990 ntTSL 55.29□□□□□ -1.562e-14■■■■■ 50.9
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SUB1P53999 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.646e-16■■■■■ 50.8
SUB1P53999 PFKP-208ENST00000433193 453 ntTSL 38.78□□□□□ -16e-16■■■■■ 50.8
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SUB1P53999 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.747e-10■■■■■ 50.7
SUB1P53999 TAX1BP1-210ENST00000488564 4020 ntTSL 57.84□□□□□ -1.157e-10■■■■■ 50.7
SUB1P53999 TAX1BP1-209ENST00000460059 527 ntTSL 33.8□□□□□ -1.87e-10■■■■■ 50.7
SUB1P53999 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.827e-10■■■■■ 50.7
SUB1P53999 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.917e-10■■■■■ 50.7
SUB1P53999 AMFR-202ENST00000492830 2249 ntTSL 210.85□□□□□ -0.672e-8■■■■■ 50.6
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