Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGGT1BP53609 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGGT1BP53609 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGGT1BP53609 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGGT1BP53609 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGGT1BP53609 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGGT1BP53609 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGGT1BP53609 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGGT1BP53609 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGGT1BP53609 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGGT1BP53609 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGGT1BP53609 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGGT1BP53609 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGGT1BP53609 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGGT1BP53609 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGGT1BP53609 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGGT1BP53609 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGGT1BP53609 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGGT1BP53609 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGGT1BP53609 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGGT1BP53609 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGGT1BP53609 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGGT1BP53609 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGGT1BP53609 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGGT1BP53609 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGGT1BP53609 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGGT1BP53609 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGGT1BP53609 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGGT1BP53609 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PGGT1BP53609 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGGT1BP53609 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGGT1BP53609 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGGT1BP53609 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGGT1BP53609 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGGT1BP53609 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGGT1BP53609 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGGT1BP53609 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PGGT1BP53609 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGGT1BP53609 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGGT1BP53609 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGGT1BP53609 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGGT1BP53609 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGGT1BP53609 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGGT1BP53609 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGGT1BP53609 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGGT1BP53609 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGGT1BP53609 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGGT1BP53609 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGGT1BP53609 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PGGT1BP53609 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGGT1BP53609 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGGT1BP53609 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGGT1BP53609 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGGT1BP53609 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PGGT1BP53609 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGGT1BP53609 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGGT1BP53609 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGGT1BP53609 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGGT1BP53609 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGGT1BP53609 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGGT1BP53609 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGGT1BP53609 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGGT1BP53609 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGGT1BP53609 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PGGT1BP53609 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGGT1BP53609 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGGT1BP53609 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGGT1BP53609 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGGT1BP53609 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGGT1BP53609 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PGGT1BP53609 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGGT1BP53609 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGGT1BP53609 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGGT1BP53609 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGGT1BP53609 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGGT1BP53609 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGGT1BP53609 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PGGT1BP53609 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGGT1BP53609 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGGT1BP53609 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGGT1BP53609 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGGT1BP53609 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PGGT1BP53609 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGGT1BP53609 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGGT1BP53609 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PGGT1BP53609 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PGGT1BP53609 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PGGT1BP53609 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGGT1BP53609 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGGT1BP53609 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGGT1BP53609 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGGT1BP53609 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGGT1BP53609 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGGT1BP53609 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGGT1BP53609 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGGT1BP53609 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGGT1BP53609 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGGT1BP53609 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGGT1BP53609 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGGT1BP53609 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
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