Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NDST1P52848 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NDST1P52848 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NDST1P52848 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NDST1P52848 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NDST1P52848 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NDST1P52848 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NDST1P52848 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NDST1P52848 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NDST1P52848 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NDST1P52848 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NDST1P52848 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NDST1P52848 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NDST1P52848 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NDST1P52848 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NDST1P52848 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NDST1P52848 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NDST1P52848 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NDST1P52848 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NDST1P52848 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NDST1P52848 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NDST1P52848 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NDST1P52848 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NDST1P52848 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NDST1P52848 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NDST1P52848 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NDST1P52848 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NDST1P52848 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NDST1P52848 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NDST1P52848 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NDST1P52848 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NDST1P52848 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NDST1P52848 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NDST1P52848 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NDST1P52848 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NDST1P52848 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NDST1P52848 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NDST1P52848 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NDST1P52848 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NDST1P52848 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NDST1P52848 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NDST1P52848 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NDST1P52848 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NDST1P52848 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NDST1P52848 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NDST1P52848 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NDST1P52848 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NDST1P52848 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NDST1P52848 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NDST1P52848 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NDST1P52848 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NDST1P52848 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NDST1P52848 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NDST1P52848 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NDST1P52848 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NDST1P52848 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NDST1P52848 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NDST1P52848 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NDST1P52848 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NDST1P52848 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NDST1P52848 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NDST1P52848 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NDST1P52848 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NDST1P52848 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NDST1P52848 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NDST1P52848 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NDST1P52848 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NDST1P52848 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NDST1P52848 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NDST1P52848 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NDST1P52848 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NDST1P52848 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NDST1P52848 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NDST1P52848 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NDST1P52848 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NDST1P52848 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NDST1P52848 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NDST1P52848 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NDST1P52848 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NDST1P52848 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NDST1P52848 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NDST1P52848 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NDST1P52848 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NDST1P52848 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NDST1P52848 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NDST1P52848 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NDST1P52848 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NDST1P52848 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NDST1P52848 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NDST1P52848 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NDST1P52848 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NDST1P52848 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NDST1P52848 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NDST1P52848 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NDST1P52848 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NDST1P52848 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NDST1P52848 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NDST1P52848 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NDST1P52848 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NDST1P52848 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms