Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFNA3P52797 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EFNA3P52797 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFNA3P52797 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNA3P52797 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNA3P52797 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNA3P52797 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNA3P52797 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNA3P52797 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNA3P52797 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNA3P52797 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNA3P52797 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNA3P52797 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNA3P52797 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFNA3P52797 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFNA3P52797 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFNA3P52797 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFNA3P52797 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFNA3P52797 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFNA3P52797 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFNA3P52797 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFNA3P52797 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EFNA3P52797 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EFNA3P52797 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFNA3P52797 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFNA3P52797 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFNA3P52797 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFNA3P52797 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFNA3P52797 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFNA3P52797 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EFNA3P52797 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFNA3P52797 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFNA3P52797 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFNA3P52797 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFNA3P52797 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFNA3P52797 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFNA3P52797 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFNA3P52797 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFNA3P52797 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFNA3P52797 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFNA3P52797 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFNA3P52797 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EFNA3P52797 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFNA3P52797 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFNA3P52797 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EFNA3P52797 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFNA3P52797 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFNA3P52797 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFNA3P52797 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFNA3P52797 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNA3P52797 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNA3P52797 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNA3P52797 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNA3P52797 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNA3P52797 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNA3P52797 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNA3P52797 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNA3P52797 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNA3P52797 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNA3P52797 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNA3P52797 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNA3P52797 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNA3P52797 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNA3P52797 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNA3P52797 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNA3P52797 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNA3P52797 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNA3P52797 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNA3P52797 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EFNA3P52797 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFNA3P52797 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFNA3P52797 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFNA3P52797 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFNA3P52797 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFNA3P52797 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFNA3P52797 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFNA3P52797 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFNA3P52797 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EFNA3P52797 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFNA3P52797 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFNA3P52797 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFNA3P52797 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFNA3P52797 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFNA3P52797 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFNA3P52797 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFNA3P52797 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFNA3P52797 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFNA3P52797 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFNA3P52797 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFNA3P52797 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFNA3P52797 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFNA3P52797 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EFNA3P52797 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFNA3P52797 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EFNA3P52797 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFNA3P52797 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFNA3P52797 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFNA3P52797 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFNA3P52797 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFNA3P52797 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms