Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF135P52742 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF135P52742 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF135P52742 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF135P52742 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF135P52742 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF135P52742 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF135P52742 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF135P52742 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF135P52742 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF135P52742 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF135P52742 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF135P52742 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF135P52742 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF135P52742 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF135P52742 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF135P52742 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF135P52742 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF135P52742 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF135P52742 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF135P52742 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF135P52742 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF135P52742 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF135P52742 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF135P52742 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF135P52742 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF135P52742 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF135P52742 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF135P52742 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF135P52742 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF135P52742 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF135P52742 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF135P52742 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF135P52742 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF135P52742 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF135P52742 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF135P52742 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF135P52742 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF135P52742 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF135P52742 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF135P52742 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF135P52742 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF135P52742 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF135P52742 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF135P52742 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF135P52742 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF135P52742 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF135P52742 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF135P52742 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF135P52742 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF135P52742 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF135P52742 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF135P52742 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF135P52742 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF135P52742 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF135P52742 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF135P52742 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF135P52742 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF135P52742 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF135P52742 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF135P52742 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF135P52742 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF135P52742 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF135P52742 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF135P52742 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF135P52742 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF135P52742 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF135P52742 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF135P52742 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF135P52742 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF135P52742 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF135P52742 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF135P52742 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF135P52742 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF135P52742 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF135P52742 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF135P52742 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF135P52742 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF135P52742 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF135P52742 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF135P52742 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF135P52742 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF135P52742 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF135P52742 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF135P52742 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF135P52742 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF135P52742 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF135P52742 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF135P52742 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF135P52742 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF135P52742 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF135P52742 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF135P52742 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF135P52742 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF135P52742 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF135P52742 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF135P52742 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF135P52742 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF135P52742 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF135P52742 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms