Protein–RNA interactions for Protein: P52306

RAP1GDS1, Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GDS1P52306 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAP1GDS1P52306 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAP1GDS1P52306 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAP1GDS1P52306 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAP1GDS1P52306 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAP1GDS1P52306 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAP1GDS1P52306 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAP1GDS1P52306 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAP1GDS1P52306 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAP1GDS1P52306 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAP1GDS1P52306 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAP1GDS1P52306 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAP1GDS1P52306 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAP1GDS1P52306 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAP1GDS1P52306 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAP1GDS1P52306 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAP1GDS1P52306 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAP1GDS1P52306 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAP1GDS1P52306 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAP1GDS1P52306 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAP1GDS1P52306 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAP1GDS1P52306 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAP1GDS1P52306 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAP1GDS1P52306 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAP1GDS1P52306 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAP1GDS1P52306 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAP1GDS1P52306 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAP1GDS1P52306 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAP1GDS1P52306 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAP1GDS1P52306 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAP1GDS1P52306 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAP1GDS1P52306 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAP1GDS1P52306 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAP1GDS1P52306 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAP1GDS1P52306 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAP1GDS1P52306 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAP1GDS1P52306 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAP1GDS1P52306 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAP1GDS1P52306 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAP1GDS1P52306 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAP1GDS1P52306 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAP1GDS1P52306 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAP1GDS1P52306 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAP1GDS1P52306 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAP1GDS1P52306 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAP1GDS1P52306 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAP1GDS1P52306 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAP1GDS1P52306 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAP1GDS1P52306 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAP1GDS1P52306 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAP1GDS1P52306 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAP1GDS1P52306 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAP1GDS1P52306 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAP1GDS1P52306 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAP1GDS1P52306 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAP1GDS1P52306 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAP1GDS1P52306 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAP1GDS1P52306 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAP1GDS1P52306 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAP1GDS1P52306 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAP1GDS1P52306 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAP1GDS1P52306 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAP1GDS1P52306 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAP1GDS1P52306 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAP1GDS1P52306 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAP1GDS1P52306 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAP1GDS1P52306 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAP1GDS1P52306 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAP1GDS1P52306 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAP1GDS1P52306 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAP1GDS1P52306 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAP1GDS1P52306 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAP1GDS1P52306 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAP1GDS1P52306 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RAP1GDS1P52306 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAP1GDS1P52306 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAP1GDS1P52306 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAP1GDS1P52306 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAP1GDS1P52306 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAP1GDS1P52306 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAP1GDS1P52306 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RAP1GDS1P52306 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAP1GDS1P52306 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAP1GDS1P52306 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAP1GDS1P52306 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAP1GDS1P52306 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAP1GDS1P52306 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAP1GDS1P52306 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RAP1GDS1P52306 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAP1GDS1P52306 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAP1GDS1P52306 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAP1GDS1P52306 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAP1GDS1P52306 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAP1GDS1P52306 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAP1GDS1P52306 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAP1GDS1P52306 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAP1GDS1P52306 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAP1GDS1P52306 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAP1GDS1P52306 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAP1GDS1P52306 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms