Protein–RNA interactions for Protein: P49281

SLC11A2, Natural resistance-associated macrophage protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A2P49281 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC11A2P49281 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC11A2P49281 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC11A2P49281 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC11A2P49281 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC11A2P49281 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC11A2P49281 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC11A2P49281 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC11A2P49281 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC11A2P49281 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC11A2P49281 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC11A2P49281 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC11A2P49281 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC11A2P49281 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC11A2P49281 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC11A2P49281 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC11A2P49281 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC11A2P49281 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC11A2P49281 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC11A2P49281 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC11A2P49281 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC11A2P49281 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC11A2P49281 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC11A2P49281 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC11A2P49281 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC11A2P49281 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC11A2P49281 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC11A2P49281 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC11A2P49281 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC11A2P49281 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC11A2P49281 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC11A2P49281 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC11A2P49281 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC11A2P49281 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC11A2P49281 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC11A2P49281 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC11A2P49281 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC11A2P49281 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC11A2P49281 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC11A2P49281 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC11A2P49281 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC11A2P49281 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC11A2P49281 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC11A2P49281 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC11A2P49281 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC11A2P49281 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC11A2P49281 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC11A2P49281 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC11A2P49281 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC11A2P49281 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC11A2P49281 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC11A2P49281 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC11A2P49281 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC11A2P49281 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC11A2P49281 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC11A2P49281 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC11A2P49281 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC11A2P49281 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC11A2P49281 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC11A2P49281 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC11A2P49281 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC11A2P49281 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC11A2P49281 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC11A2P49281 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC11A2P49281 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC11A2P49281 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC11A2P49281 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC11A2P49281 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC11A2P49281 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC11A2P49281 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC11A2P49281 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC11A2P49281 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC11A2P49281 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC11A2P49281 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC11A2P49281 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC11A2P49281 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC11A2P49281 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC11A2P49281 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC11A2P49281 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC11A2P49281 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC11A2P49281 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC11A2P49281 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC11A2P49281 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC11A2P49281 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC11A2P49281 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC11A2P49281 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC11A2P49281 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC11A2P49281 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC11A2P49281 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC11A2P49281 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC11A2P49281 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC11A2P49281 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC11A2P49281 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC11A2P49281 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC11A2P49281 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC11A2P49281 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC11A2P49281 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC11A2P49281 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC11A2P49281 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC11A2P49281 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms