Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSNK1DP48730 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSNK1DP48730 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSNK1DP48730 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSNK1DP48730 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSNK1DP48730 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSNK1DP48730 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSNK1DP48730 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSNK1DP48730 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSNK1DP48730 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSNK1DP48730 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSNK1DP48730 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSNK1DP48730 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSNK1DP48730 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSNK1DP48730 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CSNK1DP48730 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSNK1DP48730 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSNK1DP48730 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSNK1DP48730 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSNK1DP48730 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSNK1DP48730 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CSNK1DP48730 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSNK1DP48730 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CSNK1DP48730 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CSNK1DP48730 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSNK1DP48730 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSNK1DP48730 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CSNK1DP48730 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSNK1DP48730 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSNK1DP48730 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSNK1DP48730 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSNK1DP48730 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSNK1DP48730 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSNK1DP48730 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSNK1DP48730 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CSNK1DP48730 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSNK1DP48730 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSNK1DP48730 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSNK1DP48730 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSNK1DP48730 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSNK1DP48730 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSNK1DP48730 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSNK1DP48730 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSNK1DP48730 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSNK1DP48730 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CSNK1DP48730 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CSNK1DP48730 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSNK1DP48730 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSNK1DP48730 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSNK1DP48730 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSNK1DP48730 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSNK1DP48730 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSNK1DP48730 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSNK1DP48730 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSNK1DP48730 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSNK1DP48730 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSNK1DP48730 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSNK1DP48730 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSNK1DP48730 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSNK1DP48730 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSNK1DP48730 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSNK1DP48730 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSNK1DP48730 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSNK1DP48730 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSNK1DP48730 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSNK1DP48730 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSNK1DP48730 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSNK1DP48730 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CSNK1DP48730 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CSNK1DP48730 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSNK1DP48730 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSNK1DP48730 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CSNK1DP48730 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSNK1DP48730 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSNK1DP48730 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSNK1DP48730 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSNK1DP48730 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSNK1DP48730 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSNK1DP48730 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSNK1DP48730 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CSNK1DP48730 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSNK1DP48730 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSNK1DP48730 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSNK1DP48730 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSNK1DP48730 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSNK1DP48730 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSNK1DP48730 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSNK1DP48730 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSNK1DP48730 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSNK1DP48730 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSNK1DP48730 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CSNK1DP48730 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSNK1DP48730 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSNK1DP48730 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSNK1DP48730 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSNK1DP48730 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSNK1DP48730 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSNK1DP48730 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSNK1DP48730 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSNK1DP48730 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114 ms