Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRIP1P48552 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NRIP1P48552 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRIP1P48552 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRIP1P48552 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRIP1P48552 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRIP1P48552 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRIP1P48552 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRIP1P48552 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRIP1P48552 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NRIP1P48552 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRIP1P48552 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRIP1P48552 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRIP1P48552 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRIP1P48552 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NRIP1P48552 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRIP1P48552 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRIP1P48552 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRIP1P48552 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRIP1P48552 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRIP1P48552 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRIP1P48552 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NRIP1P48552 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRIP1P48552 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRIP1P48552 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRIP1P48552 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRIP1P48552 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRIP1P48552 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NRIP1P48552 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRIP1P48552 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NRIP1P48552 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRIP1P48552 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRIP1P48552 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NRIP1P48552 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NRIP1P48552 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NRIP1P48552 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NRIP1P48552 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NRIP1P48552 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NRIP1P48552 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRIP1P48552 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRIP1P48552 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRIP1P48552 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRIP1P48552 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NRIP1P48552 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NRIP1P48552 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRIP1P48552 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NRIP1P48552 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NRIP1P48552 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NRIP1P48552 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NRIP1P48552 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NRIP1P48552 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NRIP1P48552 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NRIP1P48552 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRIP1P48552 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRIP1P48552 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRIP1P48552 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRIP1P48552 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NRIP1P48552 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NRIP1P48552 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRIP1P48552 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NRIP1P48552 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NRIP1P48552 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NRIP1P48552 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NRIP1P48552 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NRIP1P48552 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRIP1P48552 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRIP1P48552 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRIP1P48552 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRIP1P48552 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRIP1P48552 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRIP1P48552 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRIP1P48552 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NRIP1P48552 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRIP1P48552 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRIP1P48552 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRIP1P48552 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRIP1P48552 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRIP1P48552 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRIP1P48552 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRIP1P48552 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRIP1P48552 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRIP1P48552 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRIP1P48552 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRIP1P48552 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRIP1P48552 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRIP1P48552 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRIP1P48552 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRIP1P48552 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRIP1P48552 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRIP1P48552 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRIP1P48552 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRIP1P48552 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms