Protein–RNA interactions for Protein: P46459

NSF, Vesicle-fusing ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSFP46459 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NSFP46459 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NSFP46459 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NSFP46459 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NSFP46459 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NSFP46459 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NSFP46459 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NSFP46459 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NSFP46459 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NSFP46459 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NSFP46459 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NSFP46459 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NSFP46459 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NSFP46459 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NSFP46459 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NSFP46459 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NSFP46459 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NSFP46459 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NSFP46459 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NSFP46459 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NSFP46459 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NSFP46459 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSFP46459 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSFP46459 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSFP46459 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSFP46459 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NSFP46459 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NSFP46459 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NSFP46459 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NSFP46459 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NSFP46459 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NSFP46459 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NSFP46459 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NSFP46459 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NSFP46459 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NSFP46459 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NSFP46459 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NSFP46459 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NSFP46459 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NSFP46459 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NSFP46459 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NSFP46459 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NSFP46459 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NSFP46459 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NSFP46459 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NSFP46459 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NSFP46459 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NSFP46459 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NSFP46459 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NSFP46459 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NSFP46459 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NSFP46459 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NSFP46459 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NSFP46459 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NSFP46459 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NSFP46459 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NSFP46459 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NSFP46459 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NSFP46459 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NSFP46459 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NSFP46459 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NSFP46459 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NSFP46459 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NSFP46459 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NSFP46459 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NSFP46459 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NSFP46459 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NSFP46459 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NSFP46459 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NSFP46459 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NSFP46459 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NSFP46459 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NSFP46459 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NSFP46459 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NSFP46459 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NSFP46459 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NSFP46459 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSFP46459 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSFP46459 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSFP46459 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSFP46459 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NSFP46459 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NSFP46459 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NSFP46459 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSFP46459 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSFP46459 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSFP46459 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSFP46459 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NSFP46459 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSFP46459 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSFP46459 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSFP46459 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSFP46459 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
NSFP46459 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NSFP46459 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NSFP46459 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NSFP46459 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NSFP46459 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NSFP46459 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NSFP46459 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms